255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2277 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  100 
 
 		 337 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  49.69 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  49.69 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  48.76 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  48.88 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  39.94 
 
 		 350 aa  259  6e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  46.98 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  52.69 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  43.18 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  40.2 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  41.94 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  43.2 
 
 		 345 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  39.57 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  43.79 
 
 		 348 aa  249  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  41.76 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  45.65 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  42.27 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  46.28 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  42.22 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  44.6 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  39.94 
 
 		 372 aa  236  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  45.45 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  40.36 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  39.86 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  40.12 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  37.66 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  35.62 
 
 		 345 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  42.5 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  38.89 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  47.99 
 
 		 331 aa  219  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  42.5 
 
 		 347 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  41.67 
 
 		 360 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  42.18 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 		 374 aa  215  9e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  35.55 
 
 		 380 aa  212  7.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  39.46 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  35.87 
 
 		 364 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  36.59 
 
 		 311 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  27.8 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  28.88 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  25.17 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  26.17 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  23.83 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  23.49 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  29.17 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  23.74 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  26.25 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  27.68 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.95 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  22.32 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  28.08 
 
 		 475 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  24.36 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.63 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.14 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  24.73 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  24.73 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.97 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.25 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  30.19 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  25.15 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.03 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  27.76 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  25.51 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  27.83 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.33 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  24.8 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.89 
 
 		 377 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1746  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.47 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0157605  normal  0.01356 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.41 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  26.89 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  24.29 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  26.56 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.78 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  24.23 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  23.19 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  23.19 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  23.19 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  25.09 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  23.19 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  25.76 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  23.19 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  24.12 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0202  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.93 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.44 
 
 		 474 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  27.56 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  23.31 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  26.52 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.97 
 
 		 466 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.38 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.79 
 
 		 477 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.6 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  23.31 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  25 
 
 		 468 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.52 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  24.16 
 
 		 377 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.27 
 
 		 469 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  23.19 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.16 
 
 		 377 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>