22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2273 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  100 
 
 
126 aa  270  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  77.78 
 
 
126 aa  229  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  76.19 
 
 
126 aa  221  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  61.11 
 
 
139 aa  175  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0449  cytochrome c family protein  54.76 
 
 
126 aa  168  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27221  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0272  cytochrome c family protein  53.6 
 
 
128 aa  155  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000807332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  50.39 
 
 
129 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1605  cytochrome c family protein  50.38 
 
 
134 aa  141  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.362415  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1148  cytochrome c family protein  43.7 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.839058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  41.67 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  37.7 
 
 
129 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  42.22 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  37.5 
 
 
126 aa  91.3  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  37.17 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  39.82 
 
 
120 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  35.04 
 
 
126 aa  76.6  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0046  hypothetical protein  41.18 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  36.14 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  30.1 
 
 
167 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2194  hypothetical protein  27.35 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1960  hypothetical protein  32.23 
 
 
137 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  26.47 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>