43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2271 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  100 
 
 		 334 aa  678    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  77.71 
 
 		 335 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  76.65 
 
 		 334 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  66.78 
 
 		 332 aa  423  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  61.89 
 
 		 330 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  61.98 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  59.09 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  53.64 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  56.57 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  60.18 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  52.98 
 
 		 342 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  53.05 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  50.91 
 
 		 331 aa  339  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  52.01 
 
 		 331 aa  338  9e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  48.48 
 
 		 331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  48.32 
 
 		 331 aa  322  6e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  50 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  34.67 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  31.37 
 
 		 233 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  35.36 
 
 		 244 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  32.85 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  32.74 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  32.96 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  27.27 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  26.87 
 
 		 256 aa  67  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  25.77 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  27.74 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  24.9 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  39.05 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  26.84 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  26.39 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  24.79 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.74 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.64 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.03 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.73 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.73 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3867  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.14 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.16 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  20.59 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  24.03 
 
 		 225 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.78 
 
 		 234 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.88 
 
 		 241 aa  42.7  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>