262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2267 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0904  hypothetical protein  34.1 
 
 
251 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  34.43 
 
 
244 aa  121  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  37.04 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  31.31 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
241 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  31.4 
 
 
238 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1657  protein of unknown function DUF45  33.01 
 
 
244 aa  105  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0875  protein of unknown function DUF45  32.86 
 
 
240 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  28.37 
 
 
244 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  30.05 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  27.23 
 
 
249 aa  95.5  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  32.37 
 
 
217 aa  94.7  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  30.33 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  26.73 
 
 
252 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  24.55 
 
 
242 aa  88.2  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0073  protein of unknown function DUF45  40.62 
 
 
316 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.658711 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  35.54 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  27.75 
 
 
224 aa  85.1  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  26.48 
 
 
262 aa  84.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  27.59 
 
 
244 aa  85.1  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  27.05 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  27.65 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  26.29 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  27.18 
 
 
237 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  22.9 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  25.84 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  29.69 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  32.98 
 
 
268 aa  79  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  27.78 
 
 
253 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  27.96 
 
 
236 aa  79  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  31.58 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  31.58 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  26.4 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  26.87 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  32.29 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  35.78 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  23.56 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  26.7 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  27.62 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  45.45 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  22.17 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  29.9 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  27 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  26.13 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  26.18 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  26.18 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  28.57 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  27.07 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  26.18 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  25.89 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1381  protein of unknown function DUF45  26.39 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.263783  normal  0.318048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  26.26 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  29.82 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  30.24 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  30.97 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  28.64 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  31.37 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  28.04 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  32.84 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  30.84 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  30.08 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  30.37 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  25.79 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  28.71 
 
 
265 aa  72  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  34.26 
 
 
340 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  29.29 
 
 
230 aa  72  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  34.26 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  26.32 
 
 
292 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  26.32 
 
 
292 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  26.32 
 
 
292 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  26.32 
 
 
292 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  26.32 
 
 
292 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  26.32 
 
 
292 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  26.32 
 
 
292 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  27.51 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  28.12 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  29.44 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  37.62 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  29.05 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  37.78 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  28.7 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  30.28 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  28.65 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  30.07 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  25.95 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  30.43 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  42.31 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  29.09 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  27.08 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  42.31 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  27.1 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  29.44 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  28.32 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  26.46 
 
 
286 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  29.11 
 
 
256 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  26.63 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  37.08 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  29.73 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>