More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2247 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 		 122 aa  227  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  88.52 
 
 		 122 aa  224  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  87.7 
 
 		 122 aa  222  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 		 122 aa  204  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  80.33 
 
 		 122 aa  202  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  202  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  199  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  199  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  199  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  81.15 
 
 		 122 aa  199  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  198  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  197  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  197  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  197  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  196  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  196  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  196  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  196  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  194  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  192  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  193  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2808  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  75.41 
 
 		 122 aa  191  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1918  50S ribosomal protein L14  76.47 
 
 		 119 aa  190  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  75.61 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2469  50S ribosomal protein L14  76.47 
 
 		 119 aa  189  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2154  50S ribosomal protein L14  76.47 
 
 		 119 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1936  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1624  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  187  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118658  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4233  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000945972  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  185  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 162 aa  185  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2315  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156512  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2976  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0383  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337556  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0391  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0304428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5060  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0485  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000117206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0330  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000152451  hitchhiker  0.00105962 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0404  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 121 aa  183  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0379  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 121 aa  183  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0063  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000810078  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000898489  unclonable  0.00000000000302699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  183  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0499  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101997  decreased coverage  0.00104649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3169  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000025532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0305  ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0494  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000512994  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3307  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000545042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>