More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2246 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  85.05 
 
 		 107 aa  190  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  87.74 
 
 		 107 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  74.55 
 
 		 110 aa  167  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  66.36 
 
 		 107 aa  156  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  61.54 
 
 		 109 aa  146  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  59.43 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  62.5 
 
 		 105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  62.5 
 
 		 105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  56.6 
 
 		 109 aa  120  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  53.27 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 105 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 		 106 aa  107  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2361  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.449778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 		 109 aa  103  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03160  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000206027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0404  ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002398  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3733  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.012207  normal  0.015742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0416  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000325696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3694  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000331178  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3625  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000301612  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3698  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000743122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3625  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00533524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3792  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256632  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0404  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839278  hitchhiker  0.0000141467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03111  hypothetical protein  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000161136  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3604  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000161475  normal  0.0245278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3503  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000502759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4632  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000390519  normal  0.45352 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3796  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3990  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0024494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0334  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000849803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  50.93 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0334  ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000366107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  55.1 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  55.1 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0730  ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00351151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4533  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114986  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06360  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127864  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0294  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000911949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3903  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000356583  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0594  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000014526  normal  0.407014 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3740  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000337214  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  50.98 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4045  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000115284  unclonable  0.00000000000347385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0211  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000151512  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3327  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000922916  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0207  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4265  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655615  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4159  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000135344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0637  ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000374833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4306  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000126624  unclonable  0.0000000000482395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0195  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000100309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000086996  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4537  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407127  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  41.82 
 
 		 110 aa  98.2  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3748  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000844667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0181  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000129578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  46.23 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0330  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.5069e-23  unclonable  0.0000000479114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3513  ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000647333  hitchhiker  0.0000000884976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  41.82 
 
 		 110 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3168  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000400105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>