More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2237 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  73 
 
 
437 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  68.58 
 
 
437 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  81.46 
 
 
437 aa  746    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
437 aa  875    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  79.18 
 
 
437 aa  731    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  71.03 
 
 
435 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  61.84 
 
 
435 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  60.23 
 
 
435 aa  565  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  60.46 
 
 
435 aa  567  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  59.08 
 
 
435 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  59.4 
 
 
435 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  59.63 
 
 
435 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  59.95 
 
 
437 aa  554  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  59.95 
 
 
429 aa  550  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  59.54 
 
 
435 aa  541  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  60.46 
 
 
442 aa  541  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  54.71 
 
 
435 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  57.94 
 
 
447 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  57.94 
 
 
447 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  55.71 
 
 
440 aa  488  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  53.92 
 
 
443 aa  485  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  57.48 
 
 
447 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  53.92 
 
 
443 aa  485  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  57.34 
 
 
445 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  55.45 
 
 
443 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  56.71 
 
 
444 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  56.51 
 
 
437 aa  480  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  55.94 
 
 
453 aa  481  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  54.44 
 
 
443 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  54.44 
 
 
443 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  54.46 
 
 
440 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  54.44 
 
 
443 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  54.44 
 
 
442 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  54.67 
 
 
442 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  54.44 
 
 
443 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  57.08 
 
 
440 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  54.44 
 
 
444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  54.44 
 
 
444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  54.23 
 
 
437 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  54.52 
 
 
444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  55.85 
 
 
436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  53.65 
 
 
442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  53.65 
 
 
442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  54.63 
 
 
439 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  54.08 
 
 
441 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  54.63 
 
 
444 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  53.95 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  54.31 
 
 
443 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  53.56 
 
 
446 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  54.39 
 
 
439 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  54.5 
 
 
437 aa  463  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  55.68 
 
 
447 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  53.64 
 
 
448 aa  463  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  54.39 
 
 
439 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  54.39 
 
 
439 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  55.87 
 
 
448 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  53.6 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  53.58 
 
 
445 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  52.1 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  53.66 
 
 
436 aa  455  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  53.26 
 
 
441 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  52.15 
 
 
439 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  54.31 
 
 
442 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  52.75 
 
 
443 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0838  preprotein translocase subunit SecY  55.32 
 
 
434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  51.76 
 
 
446 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  52.9 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  53.24 
 
 
444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  52.35 
 
 
446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  51.76 
 
 
446 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  53.53 
 
 
437 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  53.47 
 
 
443 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  53.1 
 
 
446 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  52.41 
 
 
446 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  51.61 
 
 
448 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  54.04 
 
 
445 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2304  preprotein translocase subunit SecY  56.38 
 
 
451 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  52.45 
 
 
446 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  51.75 
 
 
446 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  52.78 
 
 
443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  52.55 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  52.19 
 
 
439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  52.45 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  52.55 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 
448 aa  443  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  52.21 
 
 
446 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0340  preprotein translocase subunit SecY  52.19 
 
 
435 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670272  hitchhiker  0.000594925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  52.93 
 
 
436 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  52.08 
 
 
446 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  52.9 
 
 
444 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  52.64 
 
 
446 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0073  preprotein translocase, SecY subunit  53.15 
 
 
445 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.867918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  52.55 
 
 
443 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  53.26 
 
 
443 aa  444  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  52.21 
 
 
446 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  52.21 
 
 
446 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  52.21 
 
 
446 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  53.24 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0776  preprotein translocase subunit SecY  50.56 
 
 
455 aa  441  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  0.028717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  51.99 
 
 
446 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>