More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2234 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 122 aa  243  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  89.34 
 
 		 122 aa  224  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  89.34 
 
 		 122 aa  224  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  85.25 
 
 		 122 aa  216  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  77.05 
 
 		 123 aa  202  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  77.87 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 125 aa  176  8e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  174  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 124 aa  173  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 123 aa  170  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 123 aa  167  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 123 aa  167  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 123 aa  166  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 126 aa  167  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  166  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  67.77 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  70.43 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 123 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  67.5 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  65 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  65.25 
 
 		 128 aa  159  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  65.25 
 
 		 128 aa  159  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 116 aa  159  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  62.61 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  157  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 124 aa  157  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 125 aa  157  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  63.11 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  156  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  58.2 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 147 aa  153  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  154  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 126 aa  153  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 124 aa  153  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  153  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 125 aa  153  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 121 aa  153  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 127 aa  153  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  59.5 
 
 		 123 aa  151  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>