More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2187 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 
327 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  69.75 
 
 
331 aa  471  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  64.76 
 
 
356 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  63.78 
 
 
324 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  57.55 
 
 
323 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  57.37 
 
 
324 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  60.13 
 
 
332 aa  368  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  56.44 
 
 
332 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  55.45 
 
 
329 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  53.09 
 
 
324 aa  365  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  52.16 
 
 
325 aa  359  4e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  53.03 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  55.15 
 
 
332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  54.09 
 
 
328 aa  354  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  52.32 
 
 
333 aa  354  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  53.14 
 
 
327 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 
337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 
337 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 
332 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 
332 aa  349  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  52.04 
 
 
321 aa  348  5e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  54.75 
 
 
327 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  52.05 
 
 
326 aa  345  4e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  55.21 
 
 
320 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  52.2 
 
 
328 aa  342  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  50.92 
 
 
326 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  54.55 
 
 
328 aa  341  8e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 
328 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 
328 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  53.61 
 
 
328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  54.11 
 
 
327 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  50.94 
 
 
330 aa  339  4e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  50.94 
 
 
330 aa  339  4e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  51.9 
 
 
329 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  51.1 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  52.34 
 
 
332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  52.83 
 
 
328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  53.14 
 
 
328 aa  334  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  53.14 
 
 
328 aa  334  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  52.96 
 
 
337 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  53.44 
 
 
329 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  51.09 
 
 
330 aa  333  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  52.35 
 
 
331 aa  332  6e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  49.84 
 
 
332 aa  330  1e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  52.83 
 
 
330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  52.19 
 
 
331 aa  328  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
330 aa  328  7e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 
330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 
330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 
349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  50.46 
 
 
333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  52.96 
 
 
333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 
330 aa  326  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 
330 aa  326  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  52.83 
 
 
329 aa  326  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 
328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 
330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  51.1 
 
 
334 aa  325  5e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
330 aa  324  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 
331 aa  323  2e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  50.78 
 
 
327 aa  323  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
324 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  51.57 
 
 
328 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  53.27 
 
 
328 aa  322  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  51.72 
 
 
329 aa  322  6e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  51.72 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
330 aa  319  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  51.57 
 
 
328 aa  318  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  51.42 
 
 
329 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  50.79 
 
 
350 aa  315  7e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  49.22 
 
 
326 aa  315  8e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 
326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  52.66 
 
 
351 aa  311  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  48.61 
 
 
327 aa  309  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  48.43 
 
 
337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  53.14 
 
 
321 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  48.6 
 
 
338 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  46.71 
 
 
328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  51.72 
 
 
330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 
330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  50.78 
 
 
330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  52.35 
 
 
322 aa  305  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  51.7 
 
 
318 aa  305  7e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  52.83 
 
 
321 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  47.37 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 
329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  52.04 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  52.78 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>