299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2117 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 566 aa  1145    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.84 
 
 		 599 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  41.74 
 
 		 562 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.08 
 
 		 563 aa  350  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 565 aa  329  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.04 
 
 		 581 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.57 
 
 		 572 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 572 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 568 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 567 aa  153  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  27.48 
 
 		 573 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 573 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.89 
 
 		 573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.6 
 
 		 566 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 		 632 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 594 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.95 
 
 		 557 aa  117  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 722 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 581 aa  104  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 613 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  26.74 
 
 		 603 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 594 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.74 
 
 		 553 aa  95.5  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  27.36 
 
 		 613 aa  94.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 607 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 573 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 573 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  25.85 
 
 		 584 aa  92.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  28.47 
 
 		 619 aa  91.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 573 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 607 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 607 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 573 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 607 aa  90.9  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 613 aa  90.5  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 556 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 638 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  28.16 
 
 		 520 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  30.51 
 
 		 586 aa  89.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  26.19 
 
 		 575 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  29.11 
 
 		 594 aa  87.8  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 607 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  28.24 
 
 		 607 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 607 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 575 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.34 
 
 		 548 aa  86.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  23.73 
 
 		 574 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  24.92 
 
 		 562 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  27.89 
 
 		 590 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  27.89 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  28.06 
 
 		 573 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.42 
 
 		 804 aa  83.6  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  25.48 
 
 		 625 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.2 
 
 		 574 aa  81.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.12 
 
 		 729 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  28.4 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 574 aa  80.5  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  27.8 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  27.18 
 
 		 616 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 592 aa  79.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  31.61 
 
 		 609 aa  79  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 599 aa  78.2  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  25.38 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 860 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.14 
 
 		 2240 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  26.65 
 
 		 587 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  26.3 
 
 		 621 aa  76.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 729 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 642 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  26.58 
 
 		 621 aa  75.5  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 595 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  26.43 
 
 		 591 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 884 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  20.87 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 572 aa  73.9  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  38.68 
 
 		 566 aa  73.6  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.62 
 
 		 571 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  28.7 
 
 		 677 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 621 aa  72  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0730  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 586 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  34.95 
 
 		 583 aa  70.5  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  24.67 
 
 		 595 aa  70.5  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  30.77 
 
 		 619 aa  70.1  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  36.27 
 
 		 593 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.02 
 
 		 594 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.61 
 
 		 882 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  36 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>