More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2115 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  60.25 
 
 		 803 aa  916    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  44.02 
 
 		 804 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 		 841 aa  1689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  59.7 
 
 		 804 aa  887    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  61.57 
 
 		 802 aa  932    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  70.65 
 
 		 818 aa  1107    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  68.66 
 
 		 804 aa  1065    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  43.28 
 
 		 800 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  40.57 
 
 		 807 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  43.49 
 
 		 801 aa  602  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  39.59 
 
 		 841 aa  595  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  42.5 
 
 		 801 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  41.71 
 
 		 804 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  42.22 
 
 		 806 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  43.07 
 
 		 804 aa  569  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  42.48 
 
 		 804 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  38.88 
 
 		 819 aa  552  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  40.42 
 
 		 813 aa  554  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  39.34 
 
 		 791 aa  550  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  39.3 
 
 		 839 aa  551  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  41.25 
 
 		 811 aa  545  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  39.65 
 
 		 820 aa  545  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  38.55 
 
 		 816 aa  445  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  35.27 
 
 		 768 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  34.86 
 
 		 768 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  33.17 
 
 		 780 aa  427  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  32.6 
 
 		 781 aa  426  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  31.74 
 
 		 774 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  34.91 
 
 		 1196 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  35.66 
 
 		 1149 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  32.79 
 
 		 793 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  35.26 
 
 		 1189 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  34.85 
 
 		 1150 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  34.81 
 
 		 1150 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  34.69 
 
 		 1150 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  33.37 
 
 		 1180 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  33.56 
 
 		 1254 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  33.45 
 
 		 1208 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.98 
 
 		 1208 aa  363  6e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  33.18 
 
 		 1208 aa  362  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  32.67 
 
 		 1214 aa  360  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  33.45 
 
 		 1136 aa  357  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  31.8 
 
 		 1183 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  32.86 
 
 		 1168 aa  354  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  33.14 
 
 		 1169 aa  355  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  31.3 
 
 		 1223 aa  354  4e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  32.15 
 
 		 1191 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  31.48 
 
 		 1264 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.54 
 
 		 1132 aa  353  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.54 
 
 		 1132 aa  352  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  32.03 
 
 		 1191 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  31.03 
 
 		 1247 aa  350  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  31.19 
 
 		 1132 aa  349  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  31.02 
 
 		 1191 aa  349  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  30.09 
 
 		 1188 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  30.99 
 
 		 1132 aa  347  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4918  B12-dependent methionine synthase  31.54 
 
 		 1248 aa  347  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  31.45 
 
 		 1197 aa  347  5e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  31.26 
 
 		 1158 aa  346  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  30.32 
 
 		 1182 aa  346  1e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  30.72 
 
 		 1272 aa  345  1e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.11 
 
 		 1133 aa  345  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.11 
 
 		 1132 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  32.23 
 
 		 1178 aa  345  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.99 
 
 		 1132 aa  344  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.99 
 
 		 1132 aa  344  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  29.98 
 
 		 1188 aa  343  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  32.39 
 
 		 1158 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  31.48 
 
 		 1224 aa  343  8e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1894  B12-dependent methionine synthase  30.24 
 
 		 1229 aa  343  9e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  32.23 
 
 		 1245 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.11 
 
 		 1133 aa  342  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  30.95 
 
 		 1257 aa  342  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  30.31 
 
 		 1182 aa  341  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  31.35 
 
 		 1234 aa  341  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  31.38 
 
 		 1132 aa  341  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  31.11 
 
 		 1234 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  31.1 
 
 		 1154 aa  340  8e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  32.62 
 
 		 1167 aa  340  8e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  32.39 
 
 		 1136 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.8 
 
 		 1132 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  31.53 
 
 		 1235 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  33.17 
 
 		 1169 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  31.69 
 
 		 1176 aa  337  3.9999999999999995e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  30.73 
 
 		 1250 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607854 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  30.32 
 
 		 1188 aa  337  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  29.38 
 
 		 1187 aa  337  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  30.67 
 
 		 1257 aa  337  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  31.53 
 
 		 1235 aa  336  9e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  30.07 
 
 		 1263 aa  336  9e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  31.92 
 
 		 1278 aa  336  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  30.46 
 
 		 1228 aa  335  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  30.83 
 
 		 1250 aa  335  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  32.27 
 
 		 1171 aa  335  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  31.1 
 
 		 1236 aa  335  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  31.54 
 
 		 1250 aa  335  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  31.76 
 
 		 1178 aa  335  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  30.3 
 
 		 1261 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  30.5 
 
 		 1245 aa  334  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  32.46 
 
 		 1199 aa  334  5e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>