More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2095 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  100 
 
 
346 aa  705  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  63.58 
 
 
346 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  61.88 
 
 
347 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  48.79 
 
 
371 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  52.85 
 
 
331 aa  318  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  46.88 
 
 
333 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  44.51 
 
 
350 aa  279  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  44.2 
 
 
350 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  44.12 
 
 
351 aa  273  2e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  42.11 
 
 
337 aa  270  3e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  41.36 
 
 
350 aa  266  3e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  41.83 
 
 
350 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  41.96 
 
 
351 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  43.81 
 
 
350 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  5.96347e-06  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  40.65 
 
 
332 aa  255  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  36.62 
 
 
354 aa  230  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  39.62 
 
 
350 aa  221  1e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  37.03 
 
 
384 aa  220  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  36.51 
 
 
338 aa  219  4e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.59336e-12  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  37.1 
 
 
362 aa  213  4e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  34.38 
 
 
325 aa  212  6e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  35.87 
 
 
355 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3583e-11 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  38.41 
 
 
341 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  32.42 
 
 
341 aa  200  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  35.24 
 
 
356 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  34.05 
 
 
335 aa  197  2e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  35.24 
 
 
356 aa  197  2e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  33.44 
 
 
335 aa  196  5e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  33.44 
 
 
335 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  33.54 
 
 
330 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  31.09 
 
 
336 aa  190  3e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  34.47 
 
 
352 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  34.57 
 
 
368 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  33.65 
 
 
335 aa  186  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.39413e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  31.5 
 
 
346 aa  186  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  36.96 
 
 
351 aa  185  9e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  33.54 
 
 
332 aa  185  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  31.99 
 
 
330 aa  184  1e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  32.92 
 
 
330 aa  184  1e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  33.54 
 
 
345 aa  184  2e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  32.6 
 
 
330 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  33.64 
 
 
339 aa  184  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  30.94 
 
 
335 aa  182  8e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  32.02 
 
 
351 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  32.29 
 
 
330 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  32.02 
 
 
351 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  32.29 
 
 
334 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.93674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  32.29 
 
 
334 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  32.02 
 
 
351 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  33.54 
 
 
332 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  33.03 
 
 
355 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  33.13 
 
 
337 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  35.16 
 
 
352 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  34.11 
 
 
337 aa  179  5e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  33.82 
 
 
357 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  33.83 
 
 
352 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  31.68 
 
 
351 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  35.96 
 
 
346 aa  174  2e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  35.65 
 
 
346 aa  172  8e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  32.83 
 
 
359 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  34.6 
 
 
346 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  33.54 
 
 
341 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  34.78 
 
 
347 aa  164  2e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  30.03 
 
 
509 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  29.68 
 
 
366 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  27.08 
 
 
324 aa  141  1e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  27.62 
 
 
397 aa  128  1e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  7.21375e-05  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  26.9 
 
 
531 aa  129  1e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  26.14 
 
 
376 aa  124  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  25 
 
 
376 aa  121  2e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
376 aa  119  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  33.17 
 
 
388 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  25.62 
 
 
335 aa  114  2e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  24.76 
 
 
378 aa  111  2e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  25.57 
 
 
517 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 
256 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  24.68 
 
 
375 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  28.97 
 
 
542 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 
762 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 
395 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  31.34 
 
 
399 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  27.39 
 
 
366 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  29.46 
 
 
217 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  29.81 
 
 
395 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  31.84 
 
 
182 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  25.94 
 
 
364 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  25.94 
 
 
364 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  26.92 
 
 
364 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 
771 aa  97.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  26.07 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  25.65 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  25.65 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  26.04 
 
 
562 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  25.65 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  25.65 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  25.65 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  30.91 
 
 
549 aa  94.7  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  26.07 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  25.94 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  25.89 
 
 
413 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>