218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2089 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  982    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  54.86 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  51.59 
 
 		 477 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  48.38 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  49.57 
 
 		 477 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  52.36 
 
 		 476 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  49.57 
 
 		 476 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  49.35 
 
 		 476 aa  438  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  50.97 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  49.12 
 
 		 475 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  49.79 
 
 		 476 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  50.11 
 
 		 475 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  49.89 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  45.9 
 
 		 493 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  49.89 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  47.4 
 
 		 482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  46.44 
 
 		 500 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  45.77 
 
 		 484 aa  396  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  44.91 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  44.12 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  43.44 
 
 		 474 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  42.58 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  44.75 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  44.28 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  46.68 
 
 		 486 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  43.74 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  41.79 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  41.61 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  43.42 
 
 		 486 aa  375  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  42.92 
 
 		 486 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  46.5 
 
 		 481 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  42.71 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  44.14 
 
 		 486 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  42.92 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  43.92 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  42 
 
 		 482 aa  372  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  41.39 
 
 		 480 aa  372  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  44.42 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  43.19 
 
 		 488 aa  365  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  42.17 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  43.6 
 
 		 484 aa  368  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  43.07 
 
 		 485 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  41.74 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  40.74 
 
 		 480 aa  366  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  41.39 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  42.71 
 
 		 488 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  42.86 
 
 		 485 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  42.42 
 
 		 485 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  41.68 
 
 		 472 aa  362  8e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  43.38 
 
 		 478 aa  360  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  42.86 
 
 		 486 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  43.86 
 
 		 480 aa  359  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  42.95 
 
 		 486 aa  359  5e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  42.5 
 
 		 477 aa  349  6e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  43.87 
 
 		 477 aa  347  2e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  41.67 
 
 		 514 aa  346  6e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  40.78 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  43.58 
 
 		 477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  43.25 
 
 		 484 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  41.75 
 
 		 473 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  40.57 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  40.76 
 
 		 502 aa  333  5e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  45.96 
 
 		 432 aa  331  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  42.95 
 
 		 479 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  41.21 
 
 		 473 aa  323  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  41.26 
 
 		 477 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  43.22 
 
 		 472 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  42.45 
 
 		 487 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  43.24 
 
 		 487 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  42.62 
 
 		 488 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  45.01 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  39.58 
 
 		 963 aa  310  4e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  40.99 
 
 		 447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  45.17 
 
 		 988 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  43.1 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  47.37 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  31.72 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  29.91 
 
 		 396 aa  163  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  30.19 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  30 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  28.93 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  27.88 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  32.58 
 
 		 410 aa  151  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  28.75 
 
 		 466 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  29.38 
 
 		 402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  28.64 
 
 		 398 aa  144  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  28.98 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  28.89 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  29.56 
 
 		 446 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  27.95 
 
 		 372 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  28.38 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0355  hypothetical protein  30.98 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000772132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0348  hypothetical protein  30.43 
 
 		 379 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  28.26 
 
 		 395 aa  136  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0353  hypothetical protein  30.75 
 
 		 379 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  28.8 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0363  hypothetical protein  30.75 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  28.76 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  29.24 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  30.36 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>