258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2055 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  100 
 
 
151 aa  298  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0497  GatB/YqeY family protein  65.07 
 
 
148 aa  184  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  59.46 
 
 
149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  57.05 
 
 
178 aa  170  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  54.05 
 
 
148 aa  155  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  46.98 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  47.26 
 
 
147 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  46.58 
 
 
147 aa  134  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
149 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  42.57 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  45.21 
 
 
149 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  45.21 
 
 
149 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  45.21 
 
 
149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  43.84 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  43.54 
 
 
147 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  43.15 
 
 
147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  43.92 
 
 
148 aa  124  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  42.67 
 
 
151 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  38.62 
 
 
148 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  40.82 
 
 
147 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  41.1 
 
 
147 aa  121  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  43.54 
 
 
150 aa  120  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  43.54 
 
 
148 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  41.67 
 
 
146 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 
147 aa  120  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  43.15 
 
 
147 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  120  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  42.47 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  45.14 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  44.59 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  36.62 
 
 
150 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  41.67 
 
 
149 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  39.73 
 
 
147 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  43.06 
 
 
146 aa  117  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  117  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 
147 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  44.52 
 
 
148 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  44.52 
 
 
148 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  44.14 
 
 
151 aa  116  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  40.4 
 
 
513 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  34.97 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  42.86 
 
 
149 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  41.67 
 
 
151 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  39.46 
 
 
147 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  43.15 
 
 
149 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  37.84 
 
 
148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  42.18 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  43.42 
 
 
152 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  43.15 
 
 
148 aa  113  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  44.59 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  42.45 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  38.1 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  36.11 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  40.67 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  41.22 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  45.99 
 
 
150 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  39.73 
 
 
149 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  38.62 
 
 
150 aa  110  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  39.44 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  36.99 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  43.92 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  38.36 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  36.17 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  40.46 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  38.16 
 
 
152 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  42.47 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  38.03 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  42.18 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  38.73 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  37.24 
 
 
150 aa  107  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  37.33 
 
 
156 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  43.15 
 
 
148 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  41.78 
 
 
149 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  37.32 
 
 
147 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  37.32 
 
 
147 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  37.32 
 
 
147 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  41.78 
 
 
152 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  37.32 
 
 
147 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  37.32 
 
 
147 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  37.32 
 
 
147 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  44.52 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 
147 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  37.32 
 
 
147 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  38.36 
 
 
167 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  36.99 
 
 
147 aa  105  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  38.93 
 
 
149 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  39.52 
 
 
149 aa  104  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  45.21 
 
 
148 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  38.69 
 
 
151 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  40.14 
 
 
148 aa  103  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  39.04 
 
 
148 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  36.62 
 
 
147 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  39.04 
 
 
148 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  35.46 
 
 
149 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>