122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2051 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 228 aa  470  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  44.2 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  41.21 
 
 		 333 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  36.8 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  37.1 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  32.27 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  34.31 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  29.28 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  34.21 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  35.92 
 
 		 273 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  32.5 
 
 		 271 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  32.68 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  34.69 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  33.58 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  35.92 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  31.98 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  31.29 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  37.01 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  31.08 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  32.65 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  32.67 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.77 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  37.04 
 
 		 350 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  34.44 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  36.15 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  28.08 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  33.07 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  31.29 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  36.22 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  30.26 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  29.59 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  28.08 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  32.56 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  33.59 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  38.95 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  27.4 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  32.41 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  31.69 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  31.75 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  34.04 
 
 		 276 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  28.73 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  29.56 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  27.83 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  34.87 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  32.28 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.41 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.09 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  29.75 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  35.71 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  36.67 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  32.81 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  27.08 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  33.96 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  27.91 
 
 		 171 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  29.32 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  29.32 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  26.09 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  26.8 
 
 		 327 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  32.68 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  23.05 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  32.39 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  38.46 
 
 		 257 aa  52.8  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  33.82 
 
 		 179 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  29.21 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  36.21 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  28.88 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  27.89 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  31.45 
 
 		 170 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  34.11 
 
 		 171 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  33.06 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  25.68 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  31.11 
 
 		 138 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  31.47 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  25.83 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  34.38 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  32.08 
 
 		 282 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  39.78 
 
 		 189 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  31.79 
 
 		 284 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  39.78 
 
 		 189 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  23.78 
 
 		 189 aa  48.5  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  31.07 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  28.47 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  30.52 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  32.82 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  33.06 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  36.22 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  27.1 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.74 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  29.55 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  36.84 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  31.97 
 
 		 148 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  32.54 
 
 		 388 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  34.26 
 
 		 180 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  27.1 
 
 		 175 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  30.07 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  33.06 
 
 		 136 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  32.06 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00258  staphylococcal nuclease domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03430)  37.97 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0130052 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  29.23 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>