More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2040 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  100 
 
 
158 aa  311  3e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  86.54 
 
 
158 aa  248  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  92.42 
 
 
158 aa  246  9e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  92.42 
 
 
158 aa  246  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  65.62 
 
 
164 aa  174  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  53.85 
 
 
162 aa  164  3e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  51.33 
 
 
168 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  51.61 
 
 
159 aa  164  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  48.99 
 
 
183 aa  163  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  52 
 
 
165 aa  162  1e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  52 
 
 
165 aa  162  1e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46725e-13 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  63.49 
 
 
166 aa  162  2e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  51.32 
 
 
163 aa  162  2e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  56.93 
 
 
147 aa  161  4e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  50 
 
 
168 aa  161  4e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  53.15 
 
 
163 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  54.68 
 
 
165 aa  158  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  57.03 
 
 
165 aa  157  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  53.52 
 
 
165 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4863e-14 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  47.06 
 
 
167 aa  156  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  53.52 
 
 
165 aa  156  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  46.41 
 
 
167 aa  153  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  49.66 
 
 
164 aa  153  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.45541e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  52.08 
 
 
163 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  51.05 
 
 
164 aa  150  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  51.41 
 
 
165 aa  148  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  46.58 
 
 
170 aa  147  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  49.66 
 
 
164 aa  147  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23984e-08 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  48.63 
 
 
161 aa  144  4e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  48.68 
 
 
166 aa  143  8e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  44.22 
 
 
159 aa  142  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  48.3 
 
 
169 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  42.47 
 
 
160 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  49.31 
 
 
518 aa  140  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  51.68 
 
 
189 aa  139  1e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  42.41 
 
 
165 aa  139  2e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  43.05 
 
 
174 aa  139  2e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  43.71 
 
 
173 aa  138  4e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  43.51 
 
 
161 aa  137  5e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  44.08 
 
 
163 aa  137  8e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.42 
 
 
164 aa  136  9e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  43.42 
 
 
164 aa  136  9e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  43.42 
 
 
164 aa  136  9e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  43.42 
 
 
164 aa  136  9e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  44.37 
 
 
164 aa  136  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  49.25 
 
 
157 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  46.15 
 
 
161 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  42.11 
 
 
163 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  43.62 
 
 
164 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  43.57 
 
 
169 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  41.29 
 
 
159 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  44.6 
 
 
187 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  41.29 
 
 
159 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  42.07 
 
 
159 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  40 
 
 
164 aa  135  3e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  41.4 
 
 
164 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  46.21 
 
 
166 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  43.62 
 
 
164 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  43.62 
 
 
164 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  43.42 
 
 
164 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  43.62 
 
 
164 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  43.62 
 
 
164 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  40.51 
 
 
163 aa  134  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  42.14 
 
 
171 aa  134  7e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  42.86 
 
 
163 aa  133  1e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  44.14 
 
 
218 aa  132  1e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  39.1 
 
 
162 aa  132  2e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  42.76 
 
 
164 aa  132  2e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  40 
 
 
177 aa  132  2e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.38 
 
 
164 aa  132  2e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  40 
 
 
177 aa  132  2e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  40 
 
 
171 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  45.93 
 
 
145 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  40.71 
 
 
163 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  40 
 
 
171 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  40.71 
 
 
163 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  42 
 
 
161 aa  131  4e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  40 
 
 
163 aa  130  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  48.15 
 
 
148 aa  130  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  40 
 
 
167 aa  130  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  41.43 
 
 
166 aa  130  7e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  39.31 
 
 
171 aa  130  8e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  43.24 
 
 
164 aa  130  8e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.79 
 
 
164 aa  130  8e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  40.71 
 
 
165 aa  130  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  40.71 
 
 
165 aa  130  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  40.71 
 
 
165 aa  130  1e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  40 
 
 
174 aa  129  1e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.91 
 
 
174 aa  129  1e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  39.31 
 
 
171 aa  129  2e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  41.94 
 
 
185 aa  129  2e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  42.18 
 
 
158 aa  129  2e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  40.29 
 
 
174 aa  129  2e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  40 
 
 
192 aa  129  2e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  39.31 
 
 
174 aa  128  2e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  41.67 
 
 
159 aa  129  2e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  40.4 
 
 
163 aa  129  2e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  38.82 
 
 
183 aa  129  2e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  44.03 
 
 
159 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  51.7 
 
 
159 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>