More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2013 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  100 
 
 		 480 aa  966    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  61.51 
 
 		 482 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  61.45 
 
 		 481 aa  555  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  54.7 
 
 		 475 aa  508  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  56.21 
 
 		 473 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  55.04 
 
 		 476 aa  477  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  44.28 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  44.49 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  44.84 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  45.03 
 
 		 462 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44 
 
 		 476 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  47.29 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  44.74 
 
 		 475 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.04 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  42.18 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.37 
 
 		 464 aa  342  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  43.65 
 
 		 471 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.42 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.42 
 
 		 506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.52 
 
 		 493 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.7 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  41.09 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  40.29 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40.54 
 
 		 469 aa  323  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  40.7 
 
 		 500 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  39.76 
 
 		 478 aa  316  7e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  41.5 
 
 		 506 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.69 
 
 		 504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  41.14 
 
 		 501 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.37 
 
 		 479 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.67 
 
 		 492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  40.42 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  40.79 
 
 		 473 aa  309  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  38.11 
 
 		 474 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  38.11 
 
 		 474 aa  309  9e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.16 
 
 		 472 aa  309  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  39.67 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  40.21 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  39.46 
 
 		 524 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.3 
 
 		 477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  43.81 
 
 		 498 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  39.49 
 
 		 520 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  39.46 
 
 		 524 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40 
 
 		 476 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  41.5 
 
 		 474 aa  306  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  39.21 
 
 		 473 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  39.06 
 
 		 473 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  40.35 
 
 		 514 aa  304  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  41.59 
 
 		 505 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.15 
 
 		 476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  41.04 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  39.96 
 
 		 477 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  39.96 
 
 		 477 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  43.17 
 
 		 505 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.35 
 
 		 502 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  39.31 
 
 		 500 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  39.06 
 
 		 491 aa  302  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  40.52 
 
 		 515 aa  302  8.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  40 
 
 		 503 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  41.59 
 
 		 501 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  40.5 
 
 		 473 aa  302  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  41.76 
 
 		 502 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  41.45 
 
 		 535 aa  302  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  42.48 
 
 		 498 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  39.33 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  38.99 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  41.26 
 
 		 478 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  40 
 
 		 511 aa  300  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  36.86 
 
 		 482 aa  299  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  41.88 
 
 		 518 aa  299  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  37.85 
 
 		 481 aa  299  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  40.89 
 
 		 503 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  43.15 
 
 		 516 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  39.71 
 
 		 502 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  39.71 
 
 		 502 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  38.31 
 
 		 487 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  39.71 
 
 		 502 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  40.23 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.3 
 
 		 501 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  39.64 
 
 		 476 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.45 
 
 		 483 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  37.7 
 
 		 479 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.45 
 
 		 483 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  38.17 
 
 		 501 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  41.35 
 
 		 498 aa  295  9e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  42.01 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  40.74 
 
 		 499 aa  295  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  39.87 
 
 		 461 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  40.39 
 
 		 494 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  39.18 
 
 		 473 aa  293  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  38.26 
 
 		 502 aa  293  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  39.91 
 
 		 485 aa  292  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  40.56 
 
 		 494 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  39.64 
 
 		 588 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  40.39 
 
 		 494 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  40.92 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  42.26 
 
 		 528 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  39.63 
 
 		 511 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  40.86 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  40.86 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>