21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1881 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1881  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00249021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0940  hypothetical protein  94.24 
 
 
139 aa  267  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0158947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3824  hypothetical protein  93.53 
 
 
139 aa  265  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1324  hypothetical protein  47.32 
 
 
125 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1182  hypothetical protein  47.37 
 
 
130 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51944  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2242  hypothetical protein  44.21 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.221816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1858  hypothetical protein  44.44 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572747  unclonable  3.75184e-16 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0693  hypothetical protein  42.11 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0594  hypothetical protein  46.15 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0843  conserved hypothetical protein (DUF1353 domain protein)  43.42 
 
 
123 aa  62  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292478  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1448  hypothetical protein  42.86 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.646721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4690  hypothetical protein  47.56 
 
 
245 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0229  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.942567  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0023  hypothetical protein  39.24 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0126693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3096  hypothetical protein  34.04 
 
 
230 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495233  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1148  hypothetical protein  36.71 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000012989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3602  protein of unknown function DUF1353  31.45 
 
 
261 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1653  hypothetical protein  39.77 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.53128  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1607  hypothetical protein  39.77 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000144684  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0823  hypothetical protein  38.64 
 
 
117 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00716982  normal  0.247171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2204  hypothetical protein  24.53 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.145756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>