More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1830 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1830  quinolinate synthetase  100 
 
 
346 aa  718    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1352  quinolinate synthetase  68.51 
 
 
358 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186437  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0525  quinolinate synthetase  69.63 
 
 
349 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.472845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0807  quinolinate synthetase  52.59 
 
 
348 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1372  quinolinate synthetase  51.45 
 
 
346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.32551  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0687  quinolinate synthetase  52.66 
 
 
337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0241  quinolinate synthetase  43.1 
 
 
426 aa  278  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0291672  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2776  quinolinate synthetase  43.14 
 
 
425 aa  266  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.12125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0350  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.02 
 
 
421 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.54036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0919  quinolinate synthetase  40.65 
 
 
367 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4173  quinolinate synthetase  38.9 
 
 
368 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1289  quinolinate synthetase  41.06 
 
 
375 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0340709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4546  quinolinate synthetase  38.9 
 
 
368 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0260713  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4317  quinolinate synthetase  38.26 
 
 
370 aa  256  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381105  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0917  quinolinate synthetase  42.31 
 
 
360 aa  255  9e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000424051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4325  quinolinate synthetase  38.62 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4162  quinolinate synthetase  38.62 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4561  quinolinate synthetase  38.62 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4660  quinolinate synthetase  38.62 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00639812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4508  quinolinate synthetase  38.62 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0362709 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15680  quinolinate synthetase  42.32 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.373722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1661  quinolinate synthetase  42.34 
 
 
397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.495114  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0689  quinolinate synthetase  38.62 
 
 
368 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2529  quinolinate synthetase  40.65 
 
 
367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4274  quinolinate synthetase  39.05 
 
 
368 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2297  quinolinate synthetase  40.8 
 
 
433 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000588657 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0058  quinolinate synthetase  40.88 
 
 
365 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000714365  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0057  quinolinate synthetase  40.88 
 
 
360 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4513  quinolinate synthetase  37.75 
 
 
368 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2560  quinolinate synthetase  40.52 
 
 
441 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03750  quinolinate synthetase  40.35 
 
 
435 aa  247  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.01  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3143  quinolinate synthetase  36.89 
 
 
368 aa  245  9e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2664  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.4 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1284  quinolinate synthetase complex subunit A  41.07 
 
 
386 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1458  quinolinate synthetase  41.11 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.570432  normal  0.648645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2381  quinolinate synthetase  38.17 
 
 
379 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4148  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.6 
 
 
388 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3306  quinolinate synthetase  39.64 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.448369 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0605  quinolinate synthetase  35.71 
 
 
366 aa  239  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3645  quinolinate synthetase  37.61 
 
 
366 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3557  quinolinate synthetase  39.88 
 
 
430 aa  238  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00755021  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0303  quinolinate synthetase  36.07 
 
 
365 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.527359  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2086  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.36 
 
 
412 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193365  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3149  quinolinate synthetase  39.3 
 
 
394 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322606  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0376  quinolinate synthetase  39 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3538  quinolinate synthetase  38.92 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15580  quinolinate synthetase A  38.82 
 
 
400 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1626  quinolinate synthetase  39.58 
 
 
365 aa  232  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3766  quinolinate synthetase  34.1 
 
 
365 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1796  quinolinate synthetase  40 
 
 
395 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3083  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.47 
 
 
388 aa  229  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0542584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2253  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.02 
 
 
356 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0530  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.84 
 
 
377 aa  219  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1497  quinolinate synthetase  36.28 
 
 
373 aa  214  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.611574  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2922  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.67 
 
 
377 aa  209  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0667  quinolinate synthetase  34.77 
 
 
332 aa  208  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1579  quinolinate synthetase  34.9 
 
 
372 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3122  quinolinate synthetase  38.62 
 
 
407 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174663  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0757  quinolinate synthetase  34.15 
 
 
337 aa  194  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0238  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.95 
 
 
330 aa  189  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.74 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  31.74 
 
 
301 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  34.46 
 
 
302 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  33.14 
 
 
302 aa  156  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  32.33 
 
 
303 aa  155  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.45 
 
 
324 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  34.66 
 
 
302 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  32.27 
 
 
304 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  31.83 
 
 
303 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  31.75 
 
 
304 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  30.31 
 
 
307 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.53 
 
 
307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1664  quinolinate synthetase A  32.75 
 
 
300 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.358853  unclonable  0.000000000000205147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  32.54 
 
 
304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  31.16 
 
 
298 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  30.68 
 
 
351 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  32.92 
 
 
359 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  29.65 
 
 
308 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.63 
 
 
357 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  32.75 
 
 
323 aa  142  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.37 
 
 
306 aa  142  9e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  27.43 
 
 
304 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  26.22 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.65 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  28.32 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.44 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  30.12 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0861  quinolinate synthetase  30.18 
 
 
447 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0832  quinolinate synthetase  30.18 
 
 
447 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  32.4 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  27.41 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  33.54 
 
 
343 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  30.03 
 
 
327 aa  139  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  29.5 
 
 
304 aa  139  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  31.04 
 
 
306 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  32.56 
 
 
323 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  33.04 
 
 
323 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  27.09 
 
 
317 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  30.48 
 
 
330 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  29.91 
 
 
304 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>