More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1823 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  68.96 
 
 
541 aa  760    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  74.62 
 
 
539 aa  813    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  68.04 
 
 
539 aa  763    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  69.32 
 
 
543 aa  721    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  70.09 
 
 
541 aa  775    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
543 aa  1087    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  67.78 
 
 
542 aa  721    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  82.22 
 
 
541 aa  882    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  82.93 
 
 
541 aa  870    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  58.22 
 
 
542 aa  623  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  57.69 
 
 
565 aa  599  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  55.15 
 
 
548 aa  589  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  57.2 
 
 
564 aa  591  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  56.06 
 
 
556 aa  586  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  54.6 
 
 
544 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  55.58 
 
 
552 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  54.11 
 
 
554 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  53.07 
 
 
545 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  53.17 
 
 
563 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  52.27 
 
 
563 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  52.27 
 
 
563 aa  554  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  51.69 
 
 
555 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  52.5 
 
 
535 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  51.52 
 
 
540 aa  537  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  51.45 
 
 
558 aa  537  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  50.55 
 
 
565 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  51.34 
 
 
554 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  51.34 
 
 
554 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  52.59 
 
 
557 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  51.34 
 
 
554 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  51.42 
 
 
558 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  51.34 
 
 
558 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  53.04 
 
 
554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  53.23 
 
 
555 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  53.04 
 
 
555 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  50.48 
 
 
528 aa  485  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  46.99 
 
 
587 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  46.39 
 
 
560 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  44.81 
 
 
541 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  46.17 
 
 
564 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  43.84 
 
 
615 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  44.96 
 
 
575 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  44.62 
 
 
555 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  44.62 
 
 
555 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  45.35 
 
 
555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  44.38 
 
 
546 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  44.19 
 
 
546 aa  445  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  44.62 
 
 
638 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  43.13 
 
 
548 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  44.07 
 
 
534 aa  438  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  43.41 
 
 
552 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  43.69 
 
 
541 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  43 
 
 
540 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  45.1 
 
 
558 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  43.14 
 
 
546 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  43.81 
 
 
590 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  43.5 
 
 
534 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  43.68 
 
 
661 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 
535 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 
535 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 
535 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 
535 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 
535 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  42.52 
 
 
535 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  44.38 
 
 
556 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  43.22 
 
 
541 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 
535 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  44.25 
 
 
569 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  44.49 
 
 
566 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 
535 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  42.91 
 
 
536 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  42.88 
 
 
534 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  43.13 
 
 
541 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  42.49 
 
 
544 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  43.13 
 
 
530 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  42.63 
 
 
535 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  43.73 
 
 
543 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  42.63 
 
 
535 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  42.8 
 
 
531 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 
536 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  42.33 
 
 
535 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  42.33 
 
 
535 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  43.5 
 
 
536 aa  435  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  42.63 
 
 
535 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  42.8 
 
 
527 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  42.61 
 
 
530 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  42.91 
 
 
555 aa  435  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  42.61 
 
 
531 aa  435  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  42.33 
 
 
535 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  42.3 
 
 
534 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  42.44 
 
 
553 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  43.11 
 
 
539 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  42.63 
 
 
535 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  43.99 
 
 
542 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  42.14 
 
 
537 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  42.09 
 
 
539 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  42.22 
 
 
530 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  42.41 
 
 
530 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  42.09 
 
 
556 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  42.41 
 
 
530 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>