More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1818 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  68.8 
 
 		 532 aa  754    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  62.76 
 
 		 531 aa  648    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 530 aa  1058    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  63.43 
 
 		 533 aa  671    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  65.79 
 
 		 532 aa  729    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  59.74 
 
 		 526 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  50.75 
 
 		 533 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  46.27 
 
 		 533 aa  475  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  51.22 
 
 		 524 aa  472  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  47.87 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  45.37 
 
 		 530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  45.32 
 
 		 533 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  44.74 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  44.74 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  44.94 
 
 		 530 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  47.65 
 
 		 525 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  45.51 
 
 		 533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  43.45 
 
 		 534 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  43.39 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.22 
 
 		 856 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  42.94 
 
 		 529 aa  392  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  43.21 
 
 		 521 aa  389  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  43.48 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  45.44 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  45.44 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  42.16 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  41.59 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  45.19 
 
 		 618 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  40.64 
 
 		 533 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  43.84 
 
 		 632 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.56 
 
 		 853 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  41.6 
 
 		 526 aa  365  1e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  40.53 
 
 		 534 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  40.39 
 
 		 522 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  41.39 
 
 		 625 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  42.77 
 
 		 632 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  40.41 
 
 		 533 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  40.11 
 
 		 535 aa  359  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  46.09 
 
 		 621 aa  359  8e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  42.57 
 
 		 632 aa  358  9e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  42.5 
 
 		 512 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  43.82 
 
 		 604 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  40.57 
 
 		 533 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  43.3 
 
 		 614 aa  356  6.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  44.98 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  41.62 
 
 		 614 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  43.03 
 
 		 554 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 		 533 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  43.57 
 
 		 609 aa  353  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  44.02 
 
 		 640 aa  353  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  41.97 
 
 		 607 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  42 
 
 		 636 aa  350  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  39.12 
 
 		 531 aa  350  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  39.49 
 
 		 532 aa  349  5e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  40.11 
 
 		 533 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  42.74 
 
 		 554 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  42.74 
 
 		 554 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  39.59 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  40.96 
 
 		 537 aa  348  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01048  preprotein translocase subunit SecD  41.64 
 
 		 607 aa  348  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  38.36 
 
 		 532 aa  347  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1236  preprotein translocase subunit SecD  40.08 
 
 		 526 aa  347  3e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.543695  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.37 
 
 		 856 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2433  preprotein translocase subunit SecD  43.28 
 
 		 618 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0630  preprotein translocase subunit SecD  40.08 
 
 		 526 aa  347  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  41.06 
 
 		 616 aa  346  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  41.58 
 
 		 554 aa  346  5e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  40.26 
 
 		 526 aa  346  6e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  42.55 
 
 		 623 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  39.82 
 
 		 534 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  40.11 
 
 		 521 aa  343  5.999999999999999e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  43.44 
 
 		 622 aa  342  9e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  39.53 
 
 		 604 aa  339  7e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  39.53 
 
 		 604 aa  339  7e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  39.37 
 
 		 534 aa  339  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  37.66 
 
 		 551 aa  339  8e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  39.53 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  39.53 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  39.53 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  39.53 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  39.53 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  39.53 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  39.53 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  38.35 
 
 		 554 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.72 
 
 		 839 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0272  preprotein translocase subunit SecD  43.68 
 
 		 617 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424344  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  42.57 
 
 		 626 aa  336  7e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  39.02 
 
 		 604 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.31 
 
 		 845 aa  335  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0507  preprotein translocase subunit SecD  39.27 
 
 		 615 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.714923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  38.62 
 
 		 535 aa  334  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0466  preprotein translocase subunit SecD  39.27 
 
 		 615 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3121  preprotein translocase subunit SecD  39.02 
 
 		 615 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0447  preprotein translocase subunit SecD  39.27 
 
 		 615 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  39.02 
 
 		 615 aa  335  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  40.91 
 
 		 681 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.78 
 
 		 844 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0453  preprotein translocase subunit SecD  39.27 
 
 		 615 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0446  preprotein translocase subunit SecD  39.27 
 
 		 615 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>