More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1807 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1807  CBS  100 
 
 
298 aa  598  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  67.04 
 
 
273 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  65.07 
 
 
275 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  55.47 
 
 
371 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  52.03 
 
 
285 aa  298  7e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  49.44 
 
 
273 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  43.54 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  40.93 
 
 
443 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  38.55 
 
 
287 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  38.77 
 
 
296 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  43.8 
 
 
420 aa  192  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  38.55 
 
 
287 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  43.36 
 
 
250 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  40.59 
 
 
430 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  44.2 
 
 
285 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  38.89 
 
 
295 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  35.32 
 
 
279 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  35.32 
 
 
279 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  35.32 
 
 
279 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  39.27 
 
 
284 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  37.24 
 
 
291 aa  182  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  38.02 
 
 
281 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  39.66 
 
 
309 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  35.32 
 
 
279 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  39.22 
 
 
298 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  36.06 
 
 
280 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0439  CBS domain-containing protein  38.74 
 
 
289 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1565  transporter-associated region  38.91 
 
 
284 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  39.86 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  35.69 
 
 
280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  39.22 
 
 
309 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 
276 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  40.17 
 
 
293 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  35.32 
 
 
279 aa  178  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4209  CBS domain-containing protein  37.7 
 
 
284 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  37.66 
 
 
285 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  37.97 
 
 
279 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  41.33 
 
 
435 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  35.06 
 
 
279 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  41.27 
 
 
421 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  34.66 
 
 
279 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.22 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0539  CBS domain containing protein  37.9 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  42.54 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0523  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0257168 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.49 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.49 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.49 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.49 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.49 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  36.65 
 
 
434 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.49 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.49 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4763  CBS domain containing protein  33.9 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  34.65 
 
 
283 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  37.5 
 
 
426 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.15 
 
 
299 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.08 
 
 
295 aa  171  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  38.5 
 
 
291 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  36.2 
 
 
291 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  35.58 
 
 
424 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  36.2 
 
 
291 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  39.15 
 
 
278 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  36.17 
 
 
311 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  36.67 
 
 
293 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  37.24 
 
 
295 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  38.91 
 
 
298 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  34.25 
 
 
279 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  37.66 
 
 
311 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.86 
 
 
292 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  35.56 
 
 
311 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  36.82 
 
 
295 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  36.82 
 
 
295 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  37.24 
 
 
295 aa  168  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  36.03 
 
 
323 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  34.07 
 
 
282 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  36.82 
 
 
295 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  36.82 
 
 
295 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  36.82 
 
 
295 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  36.03 
 
 
323 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  37.39 
 
 
455 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  38.39 
 
 
421 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4185  CBS domain-containing protein  37.74 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.718893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.8 
 
 
291 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  36.8 
 
 
259 aa  166  4e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1271  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 
307 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  37.55 
 
 
446 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  38.39 
 
 
421 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  36.7 
 
 
297 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  38.55 
 
 
324 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1278  hypothetical protein  35.41 
 
 
450 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00305135  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  37.39 
 
 
455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  37.17 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  34.82 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  38.66 
 
 
447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  35.39 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  38.22 
 
 
425 aa  165  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>