More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1765 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  59.38 
 
 		 542 aa  658    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  59.37 
 
 		 545 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  62.04 
 
 		 536 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  60.48 
 
 		 542 aa  668    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  61.67 
 
 		 535 aa  666    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  57.14 
 
 		 535 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  59.96 
 
 		 552 aa  667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4661  CTP synthetase  58.67 
 
 		 557 aa  636    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  62.41 
 
 		 534 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  59.67 
 
 		 535 aa  655    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4108  CTP synthetase  59.7 
 
 		 542 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5202  CTP synthetase  59.04 
 
 		 542 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.893159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  59.48 
 
 		 540 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  57.49 
 
 		 536 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  59.37 
 
 		 546 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  58.72 
 
 		 543 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  59.67 
 
 		 535 aa  655    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  59.48 
 
 		 535 aa  653    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  59.48 
 
 		 535 aa  655    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  59.48 
 
 		 546 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  61.34 
 
 		 545 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  61.34 
 
 		 545 aa  659    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  58.72 
 
 		 543 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  57.14 
 
 		 544 aa  638    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  57.85 
 
 		 546 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  59.11 
 
 		 533 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  57.93 
 
 		 542 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  58.26 
 
 		 533 aa  652    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  60.3 
 
 		 546 aa  655    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  57.06 
 
 		 545 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  56.64 
 
 		 545 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  58.09 
 
 		 542 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  58.91 
 
 		 550 aa  663    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  59.67 
 
 		 543 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  57.49 
 
 		 536 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  62.92 
 
 		 534 aa  710    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  59.67 
 
 		 535 aa  659    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  59.55 
 
 		 545 aa  656    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3351  CTP synthetase  59.33 
 
 		 545 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000138422  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  62.78 
 
 		 538 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  100 
 
 		 548 aa  1135    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  60.56 
 
 		 543 aa  679    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  59.67 
 
 		 535 aa  655    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  58.94 
 
 		 542 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  58.07 
 
 		 545 aa  638    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  58.56 
 
 		 543 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5402  CTP synthetase  58.3 
 
 		 542 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  59.01 
 
 		 537 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  56.93 
 
 		 534 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  61.6 
 
 		 555 aa  680    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  59.37 
 
 		 545 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  58.14 
 
 		 537 aa  636    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2017  CTP synthetase  59.12 
 
 		 543 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3181  CTP synthetase  57.14 
 
 		 547 aa  639    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  60.48 
 
 		 542 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  59.63 
 
 		 543 aa  665    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2473  CTP synthetase  57.64 
 
 		 543 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  60.3 
 
 		 542 aa  663    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4476  CTP synthetase  58.01 
 
 		 543 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  58.61 
 
 		 555 aa  654    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  59.55 
 
 		 545 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2824  CTP synthetase  58.07 
 
 		 543 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  59.25 
 
 		 548 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1738  CTP synthetase  58.12 
 
 		 545 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  56.96 
 
 		 544 aa  638    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  59.19 
 
 		 544 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  58.26 
 
 		 543 aa  648    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  59.93 
 
 		 558 aa  685    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  59.37 
 
 		 545 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1170  CTP synthetase  58.01 
 
 		 543 aa  640    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.251518  normal  0.0605368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  58.5 
 
 		 544 aa  636    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  60.29 
 
 		 542 aa  666    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3107  CTP synthetase  57.93 
 
 		 542 aa  643    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  59 
 
 		 543 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  57.01 
 
 		 545 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  60.7 
 
 		 555 aa  684    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  57.33 
 
 		 535 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  57.33 
 
 		 535 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  58.42 
 
 		 555 aa  649    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  59.29 
 
 		 535 aa  652    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  59.55 
 
 		 546 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  59.37 
 
 		 546 aa  656    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  61.08 
 
 		 540 aa  675    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  59.55 
 
 		 545 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  57.06 
 
 		 542 aa  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  59.7 
 
 		 542 aa  662    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  61.11 
 
 		 533 aa  680    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  58.09 
 
 		 542 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  84.42 
 
 		 547 aa  960    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  60.48 
 
 		 551 aa  680    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  59.37 
 
 		 546 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  64.65 
 
 		 557 aa  748    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  61.47 
 
 		 547 aa  692    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  59.55 
 
 		 546 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00174  CTP synthetase  58.11 
 
 		 554 aa  636    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  61.3 
 
 		 535 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  66.73 
 
 		 553 aa  752    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  59.37 
 
 		 545 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  60.07 
 
 		 545 aa  665    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  59.78 
 
 		 542 aa  671    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>