34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1731 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  100 
 
 		 165 aa  341  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  97.18 
 
 		 72 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  65.71 
 
 		 167 aa  94.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  52.11 
 
 		 380 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  52.11 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  50.68 
 
 		 282 aa  75.1  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  50.75 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  55.71 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  43.02 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  42.39 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  50.72 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  45.07 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  50.7 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  44 
 
 		 227 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  42.65 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  39.24 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  41.67 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  41.67 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  36.36 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  38.36 
 
 		 252 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  39.19 
 
 		 256 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  38.89 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  43.06 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  40.22 
 
 		 311 aa  52  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  42.25 
 
 		 188 aa  50.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  33.75 
 
 		 243 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  33.75 
 
 		 250 aa  50.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  45.45 
 
 		 243 aa  50.8  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  40 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  41.98 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  36.71 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  37.04 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  36.84 
 
 		 242 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  34.57 
 
 		 259 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>