80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1722 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1722  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  100 
 
 
118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0271292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1393  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.754718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0253  putative signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00246404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1629  putative signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.440853  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1875  anti-sigma regulatory factor  35.87 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 
176 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1685  anti-sigma B factor  30.56 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  30.1 
 
 
160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  30.1 
 
 
160 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
143 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  30.1 
 
 
160 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  30.1 
 
 
160 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  30.1 
 
 
160 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  30.1 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  30.1 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  30.1 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  30.1 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  30.1 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0326  hypothetical protein  29.63 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2901  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00340315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 
250 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  32.29 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 
286 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5361  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
265 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2043  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000388253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  29.13 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  37.89 
 
 
1017 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  29.81 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  29.81 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  29.81 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  29.81 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  29.81 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  29.81 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  29.81 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  29.81 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0933  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0815302  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  29.81 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  29.81 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2188  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
142 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4415  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.77 
 
 
175 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00721125  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  31.25 
 
 
146 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  30.77 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  29.25 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  30.39 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3724  ATPase domain-containing protein  29.63 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  31.58 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2974  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0214018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2394  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3338  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  28.16 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  31.25 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8976  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3675  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.709341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1584  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2650  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
269 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1749  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.49 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2838  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  33.66 
 
 
147 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0194  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0731  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.993652  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0401  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0196  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  24.21 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  26.53 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4032  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  26.04 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0877  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  31.11 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4432  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.96 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3647  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1438  putative anti-sigma regulatory factor  30.61 
 
 
164 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0533473  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  25.19 
 
 
560 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>