More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1708 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  69.3 
 
 		 230 aa  310  9e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  63.68 
 
 		 228 aa  286  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  55.36 
 
 		 243 aa  235  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  53.57 
 
 		 237 aa  234  7e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  52.73 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  45.54 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  41.26 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  42.45 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  44.44 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  42.15 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  42.04 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  47.85 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  38.77 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  39.11 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  44.91 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  45.58 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  41.86 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  47.91 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  46.67 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.99 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  41.15 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  43.42 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  44.89 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  41.43 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  46.02 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  40.09 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  38.94 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.59 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  44.86 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  43.35 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.81 
 
 		 259 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  43.05 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  42.22 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  44.49 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  42.22 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  40 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  40.09 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  42.22 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  42.15 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  42.15 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  41.7 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  43.75 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  41.7 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  42.15 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  41.7 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  42.6 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  40.83 
 
 		 243 aa  158  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  40.83 
 
 		 243 aa  158  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  44.2 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  42.6 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.27 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  38.33 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  42.38 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  42.6 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  41.99 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  38.39 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  41.7 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  43.18 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  40.18 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  42.86 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  43.9 
 
 		 377 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  45.85 
 
 		 230 aa  154  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  36.52 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  42.41 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  41.78 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  40.81 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  41.78 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  40.36 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  43.38 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  40.36 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  42.53 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  42.73 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  45.77 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  44.33 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  40.36 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  36.68 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  44.9 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  38.84 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  41.7 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  40.81 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  40.36 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  39.91 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  40.74 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  45.32 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  45.32 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  41.15 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  41.78 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  42.99 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  40.17 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>