More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1647 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
386 aa  754    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  60.58 
 
 
383 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  57.81 
 
 
388 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  51.1 
 
 
391 aa  349  5e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  33.6 
 
 
405 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 
400 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 
385 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
415 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  28.29 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
399 aa  123  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  27.58 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  27.58 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 
396 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
411 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
420 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  28.12 
 
 
394 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  27.99 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  27.8 
 
 
393 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  29.11 
 
 
392 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  27.62 
 
 
393 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
393 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
407 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  27.3 
 
 
393 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  28.05 
 
 
394 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  27.3 
 
 
393 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  27.73 
 
 
474 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
404 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  29.1 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  28.03 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.51 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.01 
 
 
395 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  30.95 
 
 
390 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  30.65 
 
 
403 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  25.19 
 
 
397 aa  92.8  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  29.38 
 
 
410 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  24.36 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  24.36 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  24.64 
 
 
432 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  24.36 
 
 
432 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.09 
 
 
386 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  24.64 
 
 
409 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
399 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  24.74 
 
 
424 aa  89.7  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.07 
 
 
409 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  29.64 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  26.71 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  24.66 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
398 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  25.79 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  28.68 
 
 
421 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  27.01 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  25.13 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.96 
 
 
541 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.78 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 
423 aa  84  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.3 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.97 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  34.72 
 
 
539 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  32.58 
 
 
469 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  25.69 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  25.07 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.29 
 
 
478 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.29 
 
 
478 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.44 
 
 
400 aa  82.8  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  34.48 
 
 
476 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.88 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  27.18 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.63 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.29 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  27.65 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.41 
 
 
479 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  32.04 
 
 
487 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.29 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.36 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.23 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  33.91 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  33.91 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.36 
 
 
480 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1878  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.04 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.998766  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  25.38 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.99 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  28.06 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  25.66 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  26.32 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  37.65 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 
528 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>