59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1587 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  48.04 
 
 		 984 aa  911    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  100 
 
 		 997 aa  2045    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  38.95 
 
 		 1000 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  45.06 
 
 		 1100 aa  873    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  23.18 
 
 		 909 aa  174  7.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  22.16 
 
 		 919 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  20.6 
 
 		 911 aa  155  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  24.49 
 
 		 968 aa  155  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  20.92 
 
 		 951 aa  138  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1039 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  21.27 
 
 		 969 aa  110  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  21.27 
 
 		 969 aa  110  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  25.9 
 
 		 960 aa  101  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  21.92 
 
 		 781 aa  89.7  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  26.27 
 
 		 780 aa  79.7  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  24.94 
 
 		 783 aa  79.3  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  22.16 
 
 		 803 aa  73.6  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  26.38 
 
 		 781 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  22.09 
 
 		 788 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  22.4 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  22.86 
 
 		 786 aa  63.2  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  21.77 
 
 		 788 aa  62.4  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  28.49 
 
 		 1015 aa  59.7  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  24.38 
 
 		 1047 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  24.38 
 
 		 1047 aa  58.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  25.57 
 
 		 991 aa  58.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  24.12 
 
 		 962 aa  57.4  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1049 aa  57  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  24.69 
 
 		 1045 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1042 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  24.93 
 
 		 1049 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  27.08 
 
 		 947 aa  54.3  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  26.97 
 
 		 1041 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.74 
 
 		 989 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  24.69 
 
 		 1000 aa  53.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  22.68 
 
 		 999 aa  52.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.42 
 
 		 958 aa  52  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1151 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1048 aa  51.6  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.07 
 
 		 1048 aa  51.6  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  26.37 
 
 		 951 aa  51.2  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  26.11 
 
 		 1037 aa  51.2  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1053 aa  50.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  24.93 
 
 		 976 aa  50.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  24.72 
 
 		 922 aa  50.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1049 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  24.77 
 
 		 1054 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08480  RecB family exonuclease  26.79 
 
 		 889 aa  48.9  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  24.86 
 
 		 993 aa  48.9  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.43 
 
 		 915 aa  48.9  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1079 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.34 
 
 		 916 aa  47.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.35 
 
 		 1048 aa  47  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.12 
 
 		 1049 aa  47  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.56 
 
 		 957 aa  47  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 		 1016 aa  45.4  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  25.81 
 
 		 991 aa  44.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  24.86 
 
 		 865 aa  44.7  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  25.94 
 
 		 896 aa  44.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>