More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1585 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  100 
 
 
332 aa  677    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  53.44 
 
 
373 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0767  integrase family protein  52.96 
 
 
371 aa  309  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0883457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  45.96 
 
 
312 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  48.73 
 
 
306 aa  275  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  71.86 
 
 
472 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  41.72 
 
 
332 aa  222  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  40.85 
 
 
293 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  42.86 
 
 
342 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  39.81 
 
 
302 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  38.76 
 
 
294 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  40.88 
 
 
304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  39.12 
 
 
308 aa  215  9e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  40.07 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  42.55 
 
 
343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  42.55 
 
 
343 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  35.78 
 
 
302 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  36.74 
 
 
302 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  38.69 
 
 
294 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  36.1 
 
 
302 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  38.16 
 
 
294 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  38.96 
 
 
301 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  39.68 
 
 
311 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  38.26 
 
 
328 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  39.03 
 
 
317 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  40.98 
 
 
307 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  39.23 
 
 
302 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  36.01 
 
 
296 aa  203  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  38.44 
 
 
335 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  40.98 
 
 
307 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  39.61 
 
 
294 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  41.06 
 
 
307 aa  202  7e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  41.59 
 
 
311 aa  202  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  34.67 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  38.49 
 
 
290 aa  200  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  39.23 
 
 
306 aa  199  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  36.04 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.06 
 
 
299 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  34.97 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.07 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.06 
 
 
299 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.06 
 
 
299 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  37.09 
 
 
296 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.06 
 
 
299 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.06 
 
 
299 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  39.59 
 
 
395 aa  195  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  39.13 
 
 
298 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.06 
 
 
299 aa  195  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.06 
 
 
299 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.42 
 
 
299 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 
298 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.77 
 
 
299 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.85 
 
 
315 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 
298 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.83 
 
 
299 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 
298 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 
298 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.77 
 
 
299 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  34.63 
 
 
295 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 
298 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 
298 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  33.33 
 
 
295 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  37.91 
 
 
291 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  36.1 
 
 
302 aa  194  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.61 
 
 
313 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.86 
 
 
301 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 
298 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  38.61 
 
 
300 aa  192  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 
298 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.13 
 
 
303 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  35.48 
 
 
298 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  37.38 
 
 
295 aa  192  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.44 
 
 
296 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  34.88 
 
 
297 aa  192  9e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  37.62 
 
 
295 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.51 
 
 
322 aa  191  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  38.71 
 
 
299 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 
309 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 
296 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 
296 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 
296 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  37.99 
 
 
304 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  33.96 
 
 
299 aa  189  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  36.09 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  32.68 
 
 
298 aa  189  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 
296 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 
296 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.38 
 
 
299 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.03 
 
 
299 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  37.62 
 
 
317 aa  189  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.85 
 
 
291 aa  189  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  33.88 
 
 
295 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.44 
 
 
303 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.44 
 
 
303 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  34.09 
 
 
296 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>