207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1580 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 263 aa  530  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  34.07 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  43.28 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  42.96 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  42.96 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  47.9 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  39.6 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  32.23 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  28.36 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  42.74 
 
 		 487 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  29.95 
 
 		 322 aa  92.4  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  25.93 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  30.18 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  30.93 
 
 		 232 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  39.6 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  29.05 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  28.1 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  28.1 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  35.17 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  29.05 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  44.9 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  28.17 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  32.32 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  38.39 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  28.64 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.75 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  27.59 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  32.21 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  24.42 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  32.21 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  32.21 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  32.21 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  32.21 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  32.21 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  32.21 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  32.21 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  32.54 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  36.73 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  31.85 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  28.24 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  32.26 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  34.96 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  39.18 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  32.26 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  32.26 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  36.21 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  27.24 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  36.22 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  34.88 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  26.67 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  34.88 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  34.88 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  33.6 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  27.2 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  35.43 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  31.18 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  34.15 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  34.15 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  34.15 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  29.67 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  34.15 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  34.69 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  34.15 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  29.66 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  24.16 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  30.26 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  32.8 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  32.8 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  32.8 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  32 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  32.23 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  35.2 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  29.55 
 
 		 333 aa  68.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  31.2 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  24.45 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  30.95 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  37.11 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  30.4 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  32 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  27.14 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>