More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1577 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  62.13 
 
 
1031 aa  1139    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
954 aa  1919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
770 aa  499  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.23 
 
 
927 aa  474  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
691 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
697 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.41 
 
 
769 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.06 
 
 
769 aa  398  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 
607 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
871 aa  395  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 
598 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  37.78 
 
 
769 aa  396  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  37.68 
 
 
774 aa  392  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  38.38 
 
 
770 aa  392  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  39.43 
 
 
610 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  35.37 
 
 
751 aa  389  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  51.55 
 
 
681 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  38.12 
 
 
601 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 
673 aa  385  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
719 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
604 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
603 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 
713 aa  382  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  44.35 
 
 
677 aa  382  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  45.47 
 
 
770 aa  383  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
606 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  32.88 
 
 
801 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 
655 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  48.58 
 
 
666 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
741 aa  379  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  36.57 
 
 
785 aa  375  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  49.23 
 
 
675 aa  376  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
701 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  33.88 
 
 
736 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  47.44 
 
 
674 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  48.06 
 
 
729 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  45.33 
 
 
803 aa  371  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  46.47 
 
 
783 aa  372  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 
671 aa  369  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 
660 aa  370  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
694 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  34.81 
 
 
720 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
702 aa  366  1e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
724 aa  366  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
688 aa  365  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  46.92 
 
 
666 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  48.06 
 
 
558 aa  363  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  45.63 
 
 
692 aa  362  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 
686 aa  361  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
673 aa  360  5e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 
671 aa  360  5e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
733 aa  360  7e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  33.93 
 
 
760 aa  360  8e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 
701 aa  358  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  43.4 
 
 
767 aa  358  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 
695 aa  357  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  33.08 
 
 
723 aa  357  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
677 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  45.09 
 
 
685 aa  357  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
709 aa  357  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 
745 aa  355  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  48.47 
 
 
679 aa  353  8e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0577  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
556 aa  352  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.482834  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36.96 
 
 
639 aa  352  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
694 aa  351  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 
919 aa  351  4e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
728 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  37.26 
 
 
766 aa  350  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.82 
 
 
681 aa  349  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
957 aa  349  1e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
730 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 
696 aa  347  7e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  31.72 
 
 
672 aa  347  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
728 aa  346  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1650  CheA signal transduction histidine kinases  31.18 
 
 
1195 aa  345  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0710672 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 
919 aa  344  4e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  35.32 
 
 
801 aa  344  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
920 aa  344  4e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
724 aa  343  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 
715 aa  341  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  34.29 
 
 
717 aa  340  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
759 aa  340  8e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  34.83 
 
 
715 aa  340  9e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
878 aa  337  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  47.53 
 
 
686 aa  337  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 
682 aa  337  7e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  42.79 
 
 
761 aa  336  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
747 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  35.47 
 
 
910 aa  335  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  33.6 
 
 
669 aa  336  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 
760 aa  334  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  42.82 
 
 
660 aa  334  6e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  46.74 
 
 
552 aa  333  7.000000000000001e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  46.74 
 
 
552 aa  333  7.000000000000001e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  45.32 
 
 
685 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
650 aa  332  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.5 
 
 
806 aa  332  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  45.48 
 
 
614 aa  332  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  45.32 
 
 
685 aa  331  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  33.75 
 
 
717 aa  331  5.0000000000000004e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>