More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1575 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1575  CheW protein  100 
 
 		 239 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  56.3 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0776  CheW protein  50.83 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.01614 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1381  CheW protein  40.15 
 
 		 245 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.519881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  38.33 
 
 		 158 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  34.53 
 
 		 158 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  36.67 
 
 		 158 aa  92  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  38.98 
 
 		 164 aa  91.7  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  31.51 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  35.83 
 
 		 158 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  33.33 
 
 		 167 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  31.39 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  30.77 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  33.09 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  34.53 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  29.65 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  33.82 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  33.58 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  40 
 
 		 518 aa  82  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  32.61 
 
 		 165 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  34.53 
 
 		 166 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  30.94 
 
 		 162 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  32.61 
 
 		 165 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  33.58 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  30.26 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  31.65 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  31.65 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  30.94 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  35.59 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30.15 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  29.08 
 
 		 165 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  29.08 
 
 		 165 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.43 
 
 		 165 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  30.51 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.4 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  29.58 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  31.43 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  31.43 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.29 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  27.21 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  30.15 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.99 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.29 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.99 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.29 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  33.58 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.68 
 
 		 161 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  26.62 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  29.41 
 
 		 166 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  32.17 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  25.97 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  33.87 
 
 		 159 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  28.26 
 
 		 164 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  28.87 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  24.26 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  26.03 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  31.88 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  28.37 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  30.15 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  37.14 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  29.85 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  33.33 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  28.87 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.2 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.94 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.68 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  28.68 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  28.68 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  28.93 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  28.68 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  29.58 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  27.94 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  28.77 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  31.2 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  32.05 
 
 		 189 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  29.93 
 
 		 167 aa  72  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  25.37 
 
 		 145 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  28.36 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  29.93 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  26.81 
 
 		 154 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  39.05 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.57 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  28.78 
 
 		 141 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  28.15 
 
 		 159 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  32.59 
 
 		 139 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  27.54 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  34.78 
 
 		 568 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  37.38 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  28.06 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  28.36 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  27.94 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>