More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1568 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1568  oligopeptide-binding protein, putative  100 
 
 		 164 aa  339  8e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.467595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  70.39 
 
 		 576 aa  235  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  65.56 
 
 		 565 aa  219  9e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  64.94 
 
 		 563 aa  215  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  57.89 
 
 		 546 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  54.61 
 
 		 540 aa  184  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  55.92 
 
 		 539 aa  183  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  52.63 
 
 		 540 aa  180  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  53.42 
 
 		 538 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  52.05 
 
 		 538 aa  176  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  51.72 
 
 		 533 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  51.72 
 
 		 534 aa  171  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  46.45 
 
 		 551 aa  150  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  37.59 
 
 		 498 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  41.61 
 
 		 559 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  34.04 
 
 		 501 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  37.06 
 
 		 622 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1403  extracellular solute-binding protein family 5  36.6 
 
 		 866 aa  96.7  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  34.64 
 
 		 619 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 		 618 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  31.94 
 
 		 557 aa  87.4  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  34.48 
 
 		 553 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  36.15 
 
 		 510 aa  85.5  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  41.88 
 
 		 511 aa  85.1  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  39.53 
 
 		 554 aa  82.4  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  38.26 
 
 		 532 aa  82  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 555 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  36.96 
 
 		 565 aa  80.5  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  37.98 
 
 		 516 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  35.71 
 
 		 516 aa  77.8  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  36 
 
 		 538 aa  77  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  34.04 
 
 		 608 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 		 508 aa  77  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 		 600 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  31.94 
 
 		 505 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 		 512 aa  75.5  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  28.29 
 
 		 518 aa  75.1  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12520  dipeptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding component  31.65 
 
 		 537 aa  74.7  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0296833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 		 528 aa  74.7  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 528 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 525 aa  73.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.59 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  34.59 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 		 593 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.62 
 
 		 594 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  35.2 
 
 		 542 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  32.85 
 
 		 520 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  32.64 
 
 		 535 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  34.75 
 
 		 516 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  32.17 
 
 		 534 aa  72  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.61 
 
 		 542 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 531 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.43 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.43 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.43 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6093  putative dipeptide ABC transporter binding protein subunit  28.89 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.43 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  31.43 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.43 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.43 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3963  hypothetical protein  30.43 
 
 		 508 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.81037  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 549 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  29.58 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 527 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.71 
 
 		 528 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.41 
 
 		 531 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.5 
 
 		 596 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.220703  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  31.21 
 
 		 545 aa  69.7  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  32.12 
 
 		 490 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 531 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 534 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  36.7 
 
 		 506 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 534 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0349  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.71 
 
 		 528 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.827651  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 531 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  32.33 
 
 		 502 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  31.88 
 
 		 502 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  32.23 
 
 		 567 aa  68.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  32.54 
 
 		 696 aa  68.6  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.345904  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 498 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 515 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  29.79 
 
 		 628 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1344  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 506 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.088373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 531 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.97 
 
 		 556 aa  68.2  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.93 
 
 		 528 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.62 
 
 		 509 aa  68.2  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70200  putative binding protein component of ABC dipeptide transporter  27.41 
 
 		 526 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 510 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  30.37 
 
 		 495 aa  67.8  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0940  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 		 559 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4375  4-phytase  27.61 
 
 		 525 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  31.67 
 
 		 544 aa  67.4  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 500 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 503 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>