More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1545 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  100 
 
 		 166 aa  341  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  68.16 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  64.8 
 
 		 174 aa  224  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  60.56 
 
 		 176 aa  215  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  56.36 
 
 		 156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  53.57 
 
 		 160 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  61.54 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  47.27 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  60.58 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  45.83 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  60.58 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  45.61 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  45.83 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  54.7 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  54.7 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  44.44 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  54.95 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  57.52 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  45.64 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  57.14 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  44.85 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  57.69 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  44.85 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  53.97 
 
 		 188 aa  131  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  55.24 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  51.22 
 
 		 222 aa  130  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  55.24 
 
 		 147 aa  130  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  53.91 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  57.41 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  58.33 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  41.94 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  45.66 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  47.26 
 
 		 196 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  48.91 
 
 		 200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  51.43 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  42.42 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  51.75 
 
 		 242 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  44.24 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  53.91 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 222 aa  124  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  53.33 
 
 		 146 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  46.83 
 
 		 135 aa  124  9e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  46.83 
 
 		 135 aa  124  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  38.6 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  49.38 
 
 		 166 aa  123  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  50 
 
 		 234 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  42.42 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  50 
 
 		 234 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  50 
 
 		 234 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  50 
 
 		 236 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  58.59 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  52.38 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  58.59 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1742  single-stranded DNA-binding protein  58.59 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.366869 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  40.43 
 
 		 188 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  46.83 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  50 
 
 		 236 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  40.7 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  57.63 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  50.38 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  47.41 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  53.77 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  47.86 
 
 		 175 aa  121  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  51.72 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  53.33 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  51.72 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  42.42 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  57.29 
 
 		 234 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0736  single-stranded DNA-binding protein  41.44 
 
 		 177 aa  121  5e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0217627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  51.89 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  57.14 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  52.38 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  51.85 
 
 		 225 aa  120  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  52.68 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2038  single-strand binding protein  50.42 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  45.77 
 
 		 231 aa  120  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  51.85 
 
 		 231 aa  120  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  42.13 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  55.21 
 
 		 236 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  54.33 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0204  single-strand binding protein  53.57 
 
 		 145 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  55.21 
 
 		 236 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  42.01 
 
 		 143 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  45.18 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  51.89 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  58.59 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  57.58 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  51.89 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  43.03 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  55.21 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  54.29 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>