221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1488 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1488  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  815    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00216876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0401  putative RNA methylase  47.3 
 
 		 387 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3255  RNA methylase family protein  46.13 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0196  putative RNA methylase  45.88 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.289998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2717  putative RNA methylase  45.62 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  41.64 
 
 		 375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  37.89 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  38.42 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  35.71 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.63 
 
 		 713 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  37.19 
 
 		 376 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  36 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  37.4 
 
 		 393 aa  239  8e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  35.73 
 
 		 393 aa  236  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  35.84 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  32.53 
 
 		 375 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  32.53 
 
 		 375 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  35.18 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.22 
 
 		 725 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.94 
 
 		 725 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2035  putative RNA methylase  36.84 
 
 		 395 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0350  putative RNA methylase  34.8 
 
 		 440 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  31.66 
 
 		 387 aa  216  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0339  putative RNA methylase  34.53 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.179905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  34.39 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  33.06 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.25 
 
 		 730 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32 
 
 		 730 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0779  putative RNA methylase  33.57 
 
 		 428 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32 
 
 		 730 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0579  putative RNA methylase  34.71 
 
 		 430 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32 
 
 		 730 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.7 
 
 		 749 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  32.9 
 
 		 762 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0683  putative RNA methylase  32.93 
 
 		 426 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0473  putative RNA methylase  35.84 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0422  putative RNA methylase  35.28 
 
 		 441 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.74 
 
 		 738 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.07 
 
 		 738 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  32.98 
 
 		 484 aa  209  9e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  33.33 
 
 		 380 aa  209  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  31.84 
 
 		 385 aa  209  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.44 
 
 		 725 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.38 
 
 		 750 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.64 
 
 		 711 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  32.97 
 
 		 374 aa  202  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0074  putative RNA methylase  34.89 
 
 		 376 aa  202  9e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.2 
 
 		 721 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  31.99 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2967  putative RNA methylase  31.23 
 
 		 419 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  36.34 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2828  putative RNA methylase:THUMP  31.96 
 
 		 417 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0688  putative RNA methylase  36.12 
 
 		 734 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0808112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.61 
 
 		 712 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.07 
 
 		 756 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4484  putative RNA methylase  35.19 
 
 		 468 aa  193  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.29 
 
 		 707 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  31.76 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.28 
 
 		 712 aa  192  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2537  putative RNA methylase  31.83 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.03 
 
 		 707 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1752  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.9 
 
 		 752 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.935518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.82 
 
 		 718 aa  190  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  35.47 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  29.11 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1322  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.57 
 
 		 712 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0919587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0598  putative RNA methylase  32.22 
 
 		 432 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116947  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4128  putative RNA methylase  35.82 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4154  putative RNA methylase  35.82 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  32.22 
 
 		 432 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.05 
 
 		 699 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.29 
 
 		 705 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0224  putative RNA methylase  33.08 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0708  putative RNA methylase  33.08 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0675  putative RNA methylase  33.08 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.936037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.73 
 
 		 709 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  29.55 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2374  THUMP domain-containing protein  31.41 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3387  N6-adenine-specific DNA methylase  31.41 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3795  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  32.11 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2677  putative RNA methylase  32.74 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.81 
 
 		 708 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0288  THUMP domain-containing protein  31.41 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1150  THUMP domain-containing protein  31.41 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3378  THUMP domain-containing protein  31.41 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.270297  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2557  THUMP domain-containing protein  31.41 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.73 
 
 		 709 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.73 
 
 		 709 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.73 
 
 		 709 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  30.77 
 
 		 378 aa  182  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31 
 
 		 711 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3344  THUMP domain-containing protein  31.41 
 
 		 430 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  31.43 
 
 		 430 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.73 
 
 		 713 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.68 
 
 		 711 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  31.88 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.73 
 
 		 713 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3711  putative RNA methylase  34.5 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.0760034 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  31.88 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>