More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1419 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  100 
 
 		 446 aa  895    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  71.59 
 
 		 448 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  69 
 
 		 466 aa  618  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  63.47 
 
 		 442 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  58.56 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  55.26 
 
 		 674 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  45.17 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  44.04 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  44.04 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  47.04 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.37 
 
 		 443 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  46.5 
 
 		 451 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  46.37 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.78 
 
 		 458 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.57 
 
 		 474 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.34 
 
 		 474 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  46.17 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  45.32 
 
 		 480 aa  345  7e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  43.31 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  43.53 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  45.71 
 
 		 458 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  45.71 
 
 		 458 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.33 
 
 		 439 aa  342  7e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  45.71 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  45.95 
 
 		 378 aa  338  8e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.69 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.85 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.79 
 
 		 460 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  46.48 
 
 		 461 aa  328  8e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  40.56 
 
 		 460 aa  328  8e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.09 
 
 		 460 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.09 
 
 		 460 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.09 
 
 		 460 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.09 
 
 		 460 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.82 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  39.38 
 
 		 484 aa  324  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  40.73 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.43 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.43 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.56 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  39.61 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.14 
 
 		 471 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  39.78 
 
 		 460 aa  319  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  40.65 
 
 		 481 aa  319  7.999999999999999e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.96 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.32 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.5 
 
 		 487 aa  316  6e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  38.18 
 
 		 488 aa  315  9e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.28 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.27 
 
 		 468 aa  312  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.79 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  39.44 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.38 
 
 		 460 aa  309  8e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.19 
 
 		 471 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  42.96 
 
 		 475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.52 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.53 
 
 		 468 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.08 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.92 
 
 		 472 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.34 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.47 
 
 		 430 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.44 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  39.71 
 
 		 395 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.8 
 
 		 474 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  39.71 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.59 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.28 
 
 		 421 aa  276  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.15 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.79 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.03 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  35.35 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.46 
 
 		 394 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.71 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.99 
 
 		 399 aa  253  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  37.26 
 
 		 469 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  37.26 
 
 		 471 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.35 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.69 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.69 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.47 
 
 		 410 aa  246  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.12 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  38.69 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.69 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.69 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.44 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.44 
 
 		 437 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.69 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  37.47 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.01 
 
 		 468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05073  putative hemolysin-type secretion transmembrane protein  38.31 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.17 
 
 		 428 aa  221  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.14 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  36.97 
 
 		 439 aa  217  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  35.78 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.55 
 
 		 390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.38 
 
 		 389 aa  212  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.85 
 
 		 518 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.8 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  30.86 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.46 
 
 		 403 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>