More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1411 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1411  30S ribosomal protein S18  100 
 
 
87 aa  178  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000532082  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2023  30S ribosomal protein S18  87.36 
 
 
87 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.344457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1351  30S ribosomal protein S18  87.36 
 
 
87 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  86.21 
 
 
87 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1829  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 
87 aa  134  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  68.24 
 
 
86 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 
83 aa  100  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 
106 aa  97.1  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  60.81 
 
 
103 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  60.53 
 
 
91 aa  93.2  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  58.67 
 
 
94 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  59.21 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  59.21 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  58.67 
 
 
110 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  63.24 
 
 
89 aa  87  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  61.19 
 
 
81 aa  87  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  55.88 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  59.42 
 
 
91 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 
95 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  60 
 
 
74 aa  82.8  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  59.68 
 
 
77 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  59.38 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  64.52 
 
 
74 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  57.14 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  50.7 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  53.03 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  51.47 
 
 
78 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  62.9 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 
78 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  51.52 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 
76 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  54.41 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  54.55 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1218  SSU ribosomal protein S18P  56.52 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  52.78 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 
96 aa  77  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 
75 aa  77  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  47.89 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 
80 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 
80 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  53.97 
 
 
78 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  50 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  61.29 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  54.41 
 
 
75 aa  76.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 
74 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  51.39 
 
 
74 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  53.12 
 
 
78 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  57.14 
 
 
78 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1166  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1402  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2250  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0913  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.317596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2414  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2289  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0004  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0418254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2181  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  47.06 
 
 
78 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1893  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6207  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  52.05 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1402  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.494221  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1872  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582114  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5172  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1895  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00156223  hitchhiker  0.0000000574659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  51.32 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1781  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.708911  normal  0.881884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1809  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  49.32 
 
 
75 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  51.32 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  48 
 
 
75 aa  73.9  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>