More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1410 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 171 aa  332  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  66.27 
 
 		 167 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  63.33 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  63.16 
 
 		 167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  61.22 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  61.76 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  48.98 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  48.98 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  48.98 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  47.97 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 147 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 151 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 147 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  48.53 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 151 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  47.41 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  48.98 
 
 		 149 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  44.9 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  39.87 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  43.71 
 
 		 151 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  42.51 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1381  ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 149 aa  124  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  47.22 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 148 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  46.94 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  46.98 
 
 		 150 aa  121  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  46.98 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  41.21 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.62 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 146 aa  120  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 147 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 149 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2383  50S ribosomal protein L9  46.62 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  44.97 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  40.24 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  36.49 
 
 		 149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  43.24 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  37.65 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  46.62 
 
 		 146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  44.79 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  40.12 
 
 		 201 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3583  50S ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237319  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 148 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  43.29 
 
 		 165 aa  114  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  44.53 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1355  ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3927  50S ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  40.59 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  48.99 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>