73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1361 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1361  polymerase  100 
 
 		 653 aa  1311    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  29.89 
 
 		 629 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  27.11 
 
 		 622 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  28.97 
 
 		 542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  29.67 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  27.72 
 
 		 461 aa  135  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  26.21 
 
 		 611 aa  132  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  27.77 
 
 		 463 aa  127  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  29.16 
 
 		 455 aa  127  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  27.68 
 
 		 530 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  25.83 
 
 		 532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  25.72 
 
 		 459 aa  113  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  25.76 
 
 		 484 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  26.17 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  24.85 
 
 		 656 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  27.62 
 
 		 501 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  26.04 
 
 		 634 aa  110  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  26.92 
 
 		 546 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  25.56 
 
 		 462 aa  109  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  25.87 
 
 		 660 aa  104  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  23.93 
 
 		 578 aa  103  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  24.35 
 
 		 525 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  24.47 
 
 		 462 aa  101  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  25.7 
 
 		 530 aa  100  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  24.94 
 
 		 546 aa  98.6  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  25.12 
 
 		 527 aa  98.2  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  29.01 
 
 		 541 aa  98.2  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  23.44 
 
 		 509 aa  97.1  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  28.57 
 
 		 556 aa  95.5  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  27.53 
 
 		 534 aa  95.1  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  26.24 
 
 		 565 aa  93.2  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  25.26 
 
 		 555 aa  91.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  25.56 
 
 		 563 aa  90.9  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  24.73 
 
 		 520 aa  90.5  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  24.94 
 
 		 529 aa  89  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  21.59 
 
 		 467 aa  88.2  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  27.61 
 
 		 556 aa  87.8  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  26.86 
 
 		 562 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000204321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  26.86 
 
 		 562 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  26.86 
 
 		 562 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  23.96 
 
 		 562 aa  87.4  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  26.6 
 
 		 563 aa  87.4  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  26.6 
 
 		 563 aa  87  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  27 
 
 		 563 aa  87  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  26.73 
 
 		 371 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  24.36 
 
 		 562 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  26.86 
 
 		 562 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  23.68 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  25.77 
 
 		 555 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  25.21 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  26.17 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  26.26 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  24.63 
 
 		 554 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  22.1 
 
 		 552 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  24.29 
 
 		 728 aa  79.7  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  27.46 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  25 
 
 		 556 aa  77  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  25.89 
 
 		 378 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  24.04 
 
 		 545 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  22.77 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  30.52 
 
 		 603 aa  70.5  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  23.88 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0429  hypothetical protein  27.46 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  20.74 
 
 		 562 aa  63.9  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0823  hypothetical protein  28.83 
 
 		 691 aa  61.6  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00604121  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000996  predicted polymerase  24.25 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  22.74 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  25.1 
 
 		 603 aa  58.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07053  hypothetical protein  25.27 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  21.24 
 
 		 556 aa  56.2  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2318  hypothetical protein  23.95 
 
 		 371 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575561 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0394  hypothetical protein  23.91 
 
 		 543 aa  51.6  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000249945  normal  0.153411 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0806  hypothetical protein  28.12 
 
 		 626 aa  45.4  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00357901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>