67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1247 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  100 
 
 
352 aa  739    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  67.14 
 
 
359 aa  502  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  66.29 
 
 
364 aa  481  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  52.83 
 
 
410 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  37.78 
 
 
373 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  39.91 
 
 
370 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  38.95 
 
 
360 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  26.07 
 
 
347 aa  130  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  34.38 
 
 
342 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  37.08 
 
 
363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  36.32 
 
 
366 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  35.87 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  29.32 
 
 
354 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  32.97 
 
 
394 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  33.49 
 
 
343 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  27.78 
 
 
383 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  25.45 
 
 
354 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  23.8 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  32.04 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  22.22 
 
 
354 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  29.1 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  26.67 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  26.2 
 
 
357 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  39.36 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  39.36 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  32.75 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  28.35 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  29.07 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  28.42 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  27.27 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  28.21 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  27.72 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  26.26 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  25.48 
 
 
753 aa  66.2  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  26.16 
 
 
372 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  22.75 
 
 
368 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  26.9 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  31.91 
 
 
416 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  23.41 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  21.38 
 
 
421 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  21.38 
 
 
421 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  26.2 
 
 
359 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  26.53 
 
 
366 aa  59.7  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  26 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  27.01 
 
 
332 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  26.7 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  30.95 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  24.17 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  25.91 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.58 
 
 
345 aa  56.6  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.5 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  26.52 
 
 
339 aa  54.3  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.5 
 
 
344 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  23.5 
 
 
341 aa  53.1  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  25.49 
 
 
334 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  25 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  25 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  26.74 
 
 
323 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  21.3 
 
 
344 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  21.18 
 
 
344 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  21.28 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  22.67 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  24.32 
 
 
437 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1791  hypothetical protein  22.73 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4359  hypothetical protein  26.18 
 
 
333 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  20.8 
 
 
341 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>