More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1185 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  100 
 
 
541 aa  1131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.66118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  46.07 
 
 
524 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  43.22 
 
 
534 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  42.36 
 
 
535 aa  416  1e-115  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  41.85 
 
 
535 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  41.24 
 
 
526 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  41.24 
 
 
526 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  41.24 
 
 
526 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  40.53 
 
 
535 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  41.24 
 
 
526 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  40.22 
 
 
530 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  41.3 
 
 
535 aa  407  1e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  41.48 
 
 
535 aa  406  1e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  41.06 
 
 
526 aa  408  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.69 
 
 
535 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.69 
 
 
535 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.69 
 
 
535 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  40.69 
 
 
535 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  40.69 
 
 
535 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.69 
 
 
535 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  40.69 
 
 
535 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  40.69 
 
 
535 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  39.78 
 
 
529 aa  402  1e-110  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  40.11 
 
 
535 aa  400  1e-110  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
535 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  42.33 
 
 
532 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  42.33 
 
 
532 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  41.2 
 
 
542 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  39.27 
 
 
535 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  39.27 
 
 
535 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  39.27 
 
 
535 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  41.57 
 
 
538 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  41.38 
 
 
565 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 
532 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  39.39 
 
 
531 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  41.37 
 
 
531 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  39.65 
 
 
546 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  39.84 
 
 
532 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  42.39 
 
 
540 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  42.5 
 
 
542 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  38.18 
 
 
532 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  39.57 
 
 
545 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 
531 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  41.52 
 
 
528 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  39.24 
 
 
541 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.7 
 
 
541 aa  362  7e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 
541 aa  362  7e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  40.27 
 
 
544 aa  362  9e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  39.85 
 
 
531 aa  362  9e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  39.85 
 
 
537 aa  359  7e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  38.31 
 
 
537 aa  357  3e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 
531 aa  357  4e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 
541 aa  356  6e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  39.06 
 
 
530 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 
530 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  39.08 
 
 
543 aa  352  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 
547 aa  352  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  38.12 
 
 
542 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  39.66 
 
 
533 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  36.76 
 
 
547 aa  350  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  39.69 
 
 
533 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0390  extracellular solute-binding protein family 5  39.81 
 
 
531 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18086  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  36.04 
 
 
531 aa  346  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 
506 aa  346  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  39.28 
 
 
532 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  41.1 
 
 
532 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  37.3 
 
 
547 aa  344  3e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0422  extracellular solute-binding protein family 5  38.93 
 
 
531 aa  344  3e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00166095  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  35.32 
 
 
531 aa  344  3e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  36.94 
 
 
542 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  37.57 
 
 
542 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  38.53 
 
 
530 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  36.7 
 
 
531 aa  341  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3963  hypothetical protein  43.11 
 
 
508 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.81037  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  36.38 
 
 
533 aa  338  2e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  38.59 
 
 
530 aa  338  2e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.42 
 
 
530 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  37.99 
 
 
530 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  36.03 
 
 
531 aa  333  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3090  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 
542 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 
542 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  36.58 
 
 
547 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  37.57 
 
 
542 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  37.57 
 
 
542 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  37.57 
 
 
542 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  36.4 
 
 
542 aa  327  4e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.72 
 
 
535 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  37.02 
 
 
542 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  37.74 
 
 
574 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  38.24 
 
 
542 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  38.24 
 
 
542 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  34.19 
 
 
542 aa  322  1e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  37.84 
 
 
536 aa  321  2e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  37.84 
 
 
542 aa  321  2e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  37.84 
 
 
542 aa  321  2e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  37.84 
 
 
542 aa  321  2e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  34.28 
 
 
589 aa  320  4e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  35.94 
 
 
535 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6392  ABC oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  36.46 
 
 
542 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 
541 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>