More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1183 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  100 
 
 		 301 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  58.1 
 
 		 304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.62 
 
 		 300 aa  334  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  58.62 
 
 		 300 aa  334  9e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  58.42 
 
 		 300 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2053  peptide ABC transporter permease  60.36 
 
 		 303 aa  328  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.942235  normal  0.455607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.67 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  55.48 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.64 
 
 		 325 aa  321  7e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.07 
 
 		 300 aa  320  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.75 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56 
 
 		 302 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.59 
 
 		 303 aa  315  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57 
 
 		 296 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5118  ABC transporter permease  57.75 
 
 		 303 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4240  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.19 
 
 		 303 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.44 
 
 		 300 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4563  dipeptide ABC transporter, permease protein  55.85 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.39 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.706102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58450  ABC transporter permease  57.75 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.39 
 
 		 308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.979311  normal  0.485884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.39 
 
 		 308 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  53.29 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  53.29 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  53.29 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  53.29 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  53.29 
 
 		 299 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.33 
 
 		 302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.0471149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.98 
 
 		 303 aa  309  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.16 
 
 		 296 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.51 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.83 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.46 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  56.09 
 
 		 302 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.1 
 
 		 287 aa  297  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.66 
 
 		 296 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.94 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.753458  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0046  dipeptide transporter  53.49 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4096  dipeptide transporter  53.54 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.16 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.69 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.2 
 
 		 305 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.64 
 
 		 305 aa  292  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3905  dipeptide transporter  54.49 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.16 
 
 		 305 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.16 
 
 		 305 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.380903 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.16 
 
 		 305 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0184  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  54.84 
 
 		 305 aa  291  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  51.93 
 
 		 317 aa  291  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.8 
 
 		 305 aa  291  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_004310  BR1584  dipeptide ABC transporter, permease protein  54.98 
 
 		 293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0222  dipeptide transport system permease protein  56.23 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  52.54 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.16 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.01 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.09 
 
 		 311 aa  277  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.8 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3904  dipeptide transporter  54.49 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3948  dipeptide transporter  54.49 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4008  dipeptide transporter  54.49 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.912863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3840  dipeptide transporter  54.49 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3826  dipeptide transporter  54.49 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.57 
 
 		 298 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0051  dipeptide transporter  54.21 
 
 		 300 aa  275  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.644242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0186  dipeptide transporter  53.82 
 
 		 300 aa  275  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0140  dipeptide transporter  52.82 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0090  dipeptide transporter  54.15 
 
 		 300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.448882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4058  dipeptide transporter  54.15 
 
 		 300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4073  dipeptide transporter  54.15 
 
 		 300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03393  dipeptide transporter  54.82 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.82 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3741  dipeptide transporter  54.82 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4034  dipeptide transporter  54.82 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0439  dipeptide transport system permease protein  58.37 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.760641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4910  dipeptide transporter  54.82 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3861  dipeptide transporter  54.82 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03344  hypothetical protein  54.82 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0258  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC  58.37 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0173  dipeptide transporter  54.82 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0245  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC  58.37 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  47.48 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.3 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.03 
 
 		 294 aa  269  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00097283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.33 
 
 		 310 aa  268  8e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  57.55 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.46 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3989  dipeptide transporter  54.15 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.87 
 
 		 280 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.45 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.87 
 
 		 280 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.76 
 
 		 295 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  47.84 
 
 		 300 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.64 
 
 		 313 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.79 
 
 		 294 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.03 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12500  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  52.86 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0323482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  48.91 
 
 		 867 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.21 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>