More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1126 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
243 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  66.52 
 
 
247 aa  323  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  66.23 
 
 
250 aa  322  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  60.18 
 
 
233 aa  297  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  63.32 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  56.11 
 
 
231 aa  276  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.41 
 
 
249 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.92 
 
 
253 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.92 
 
 
253 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  52.97 
 
 
285 aa  250  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.19 
 
 
282 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  51.93 
 
 
272 aa  248  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  52.77 
 
 
276 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
256 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  51.5 
 
 
276 aa  246  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
236 aa  245  4e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  51.06 
 
 
282 aa  244  6.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
232 aa  244  9e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  51.06 
 
 
253 aa  243  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.58 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.27 
 
 
246 aa  242  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.51 
 
 
259 aa  242  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.7 
 
 
247 aa  241  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  49.33 
 
 
236 aa  239  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50.85 
 
 
291 aa  239  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
236 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  48 
 
 
234 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
263 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.13 
 
 
259 aa  237  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
257 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  47.26 
 
 
249 aa  236  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
245 aa  236  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
241 aa  236  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  47.03 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.06 
 
 
257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
260 aa  235  6e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
258 aa  234  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  48.88 
 
 
244 aa  234  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
236 aa  234  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 
263 aa  234  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
246 aa  234  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.03 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  52.16 
 
 
255 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.28 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
258 aa  232  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  47.44 
 
 
260 aa  232  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 
251 aa  230  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
236 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
246 aa  229  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.41 
 
 
238 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
259 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
258 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
258 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
258 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  47.03 
 
 
257 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
258 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
258 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
258 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.41 
 
 
238 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
258 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.93 
 
 
251 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.63 
 
 
260 aa  228  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.72 
 
 
250 aa  228  6e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
266 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  48.93 
 
 
240 aa  228  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
250 aa  228  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
257 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.26 
 
 
249 aa  227  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
258 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.77 
 
 
254 aa  227  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
249 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
260 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
260 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
257 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  48.74 
 
 
273 aa  224  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  224  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
246 aa  224  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  48.12 
 
 
260 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.1 
 
 
249 aa  224  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.38 
 
 
249 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  46.84 
 
 
264 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
258 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.52 
 
 
256 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.42 
 
 
248 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
260 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
260 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.95 
 
 
260 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.02 
 
 
267 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  45.37 
 
 
228 aa  223  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
260 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
260 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
260 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  48.1 
 
 
275 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.41 
 
 
241 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.85 
 
 
257 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
260 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  46.41 
 
 
264 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>