More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1125 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 269 aa  534  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  51.85 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  50.75 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  46.32 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  48.72 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  39.31 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  33.83 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  35.18 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  42.41 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  32.33 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  31.82 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  33.08 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  30.68 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  30.64 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  31.09 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  30.98 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  51.22 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  49.56 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.25 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  32.13 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  34.21 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 		 368 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  33.98 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  29.48 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  34.21 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  35.57 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  30.08 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  33.33 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  30.65 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  33.33 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  33.33 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  30.65 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  29.89 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  30.26 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  37.67 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  31.43 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.41 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  34.46 
 
 		 712 aa  105  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  31.12 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  32.28 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.55 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  33.08 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  32.55 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  31.76 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  31.54 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  32.18 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  45.95 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  32.18 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  32.18 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  32.18 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  36.81 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  45.05 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  36.03 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  31.12 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  34.75 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  34.77 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2751  phosphatidate cytidylyltransferase  45.03 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  49.06 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1490  phosphatidate cytidylyltransferase  45.03 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  33.82 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  30.63 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  42.24 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  31.06 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  32.16 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  31.82 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  29.89 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  32.97 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  30.47 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  33.45 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  31.23 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  30.42 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  30.6 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  38.62 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  41.94 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>