More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1103 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  100 
 
 
461 aa  940    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  73.72 
 
 
394 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  73.4 
 
 
393 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  67.09 
 
 
398 aa  551  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  62.85 
 
 
397 aa  510  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  59.75 
 
 
396 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  56.27 
 
 
398 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  56.27 
 
 
398 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  51.79 
 
 
395 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  55.09 
 
 
400 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  47.95 
 
 
396 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  47.8 
 
 
397 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  47.24 
 
 
396 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  43.52 
 
 
398 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  44.87 
 
 
396 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 
395 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  44.56 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  44.56 
 
 
397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  44.88 
 
 
397 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  45.04 
 
 
393 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 
398 aa  349  5e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  44.73 
 
 
393 aa  346  6e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  42.12 
 
 
397 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  41.82 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  41.97 
 
 
398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 
395 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  38.4 
 
 
394 aa  282  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  39.21 
 
 
395 aa  279  7e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  38.85 
 
 
393 aa  274  3e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  37.4 
 
 
396 aa  263  4.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  39.79 
 
 
393 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  38.44 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  34.96 
 
 
405 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  34.52 
 
 
389 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 
404 aa  210  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  35.07 
 
 
389 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  34.79 
 
 
389 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  34.24 
 
 
397 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  33.88 
 
 
397 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  26.75 
 
 
403 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  34.17 
 
 
377 aa  167  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  34.17 
 
 
377 aa  167  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  35.38 
 
 
392 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  34.6 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  30.5 
 
 
375 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  32.08 
 
 
389 aa  164  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1096  aspartate aminotransferase protein  31.76 
 
 
403 aa  161  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  32.96 
 
 
392 aa  160  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  30.58 
 
 
387 aa  160  6e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  32.72 
 
 
404 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  31.71 
 
 
385 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  30.53 
 
 
389 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  30.63 
 
 
402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  32.98 
 
 
393 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  31.78 
 
 
392 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  30.6 
 
 
411 aa  154  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  32.98 
 
 
393 aa  150  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  31.7 
 
 
388 aa  150  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  30.27 
 
 
390 aa  149  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  29.74 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  31.87 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  32.63 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  33.06 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  28.91 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  30.54 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  30.54 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  30.54 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  29.29 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  30.54 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  32.27 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  29.84 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  30.54 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  32 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  32.2 
 
 
367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  32 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  29.29 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 
414 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  32.11 
 
 
399 aa  148  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  30.33 
 
 
392 aa  147  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  30.11 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  32.72 
 
 
402 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 
395 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  28.3 
 
 
379 aa  147  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  31.12 
 
 
395 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  30.27 
 
 
387 aa  147  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  31.12 
 
 
395 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  31.12 
 
 
395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.34 
 
 
396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  31.22 
 
 
389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  29.7 
 
 
402 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 
395 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  29.65 
 
 
396 aa  145  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  30.19 
 
 
399 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  29.92 
 
 
396 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  30.67 
 
 
370 aa  146  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.34 
 
 
396 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  29.82 
 
 
396 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  31.35 
 
 
395 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>