113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1086 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  31.98 
 
 
225 aa  98.6  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  28.83 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  33.16 
 
 
209 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  30.73 
 
 
299 aa  96.3  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  28.9 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  28.64 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  34.59 
 
 
301 aa  95.9  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  34.59 
 
 
301 aa  95.5  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  33 
 
 
230 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  29.76 
 
 
297 aa  93.2  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  32.97 
 
 
231 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  29.94 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  29.94 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  33.15 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  31.29 
 
 
327 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  29.21 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  31.41 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  32.4 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  35.29 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  34.12 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  33.33 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  27.4 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  30 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  27.09 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  31.52 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  30 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  28.71 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  28.71 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  32.46 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  29.44 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  29.68 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  36.24 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  35.57 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  34.78 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  36.3 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  28.33 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  27.45 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  34.62 
 
 
194 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  34.62 
 
 
194 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  34.62 
 
 
194 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  34.34 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  34.83 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  25.83 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  33.97 
 
 
195 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  33.58 
 
 
194 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  28.12 
 
 
604 aa  60.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  32.61 
 
 
195 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  33.91 
 
 
189 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  34.62 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  33.12 
 
 
194 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  34.75 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  32.62 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  32.7 
 
 
183 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  30.77 
 
 
194 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  30.77 
 
 
194 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  32.61 
 
 
195 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  32.61 
 
 
195 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  30.77 
 
 
194 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  30.77 
 
 
194 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  30.77 
 
 
194 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  32.61 
 
 
195 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  35.77 
 
 
195 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  33.09 
 
 
188 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  33.09 
 
 
188 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  31.25 
 
 
194 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  26.55 
 
 
194 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  32.82 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  33.55 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  31.88 
 
 
195 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  31.88 
 
 
195 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  26.34 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  30.51 
 
 
195 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  30.12 
 
 
194 aa  55.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  30.51 
 
 
195 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  30.51 
 
 
195 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  30.51 
 
 
195 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  30.51 
 
 
195 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  30.51 
 
 
195 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  30.51 
 
 
195 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  30.51 
 
 
195 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  22.44 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  32.05 
 
 
195 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  31.15 
 
 
187 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  29.63 
 
 
186 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  32.02 
 
 
195 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  36.21 
 
 
185 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  27.45 
 
 
556 aa  53.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  29.44 
 
 
194 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  33.33 
 
 
196 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  35.88 
 
 
195 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  36.11 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  29.32 
 
 
182 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  24.68 
 
 
246 aa  49.3  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  35.79 
 
 
196 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  24.68 
 
 
246 aa  48.9  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  31.72 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  29.08 
 
 
192 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>