More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1078 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  100 
 
 		 160 aa  318  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  48.43 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  50 
 
 		 179 aa  154  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  45.75 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  47.06 
 
 		 162 aa  153  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  48.32 
 
 		 157 aa  153  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  47.33 
 
 		 163 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  46.84 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  46.84 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  46.05 
 
 		 178 aa  151  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  50.31 
 
 		 185 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  48.95 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  46.84 
 
 		 164 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  45.22 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  49.69 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  45.96 
 
 		 173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  48.7 
 
 		 181 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  43.24 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  42.57 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  40.65 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  42.41 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  41.78 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  38.61 
 
 		 167 aa  130  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  38.82 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.34 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  41.94 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  34.62 
 
 		 187 aa  124  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  39.75 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  39.29 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  37.5 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  41.29 
 
 		 194 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  36.88 
 
 		 179 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  38.89 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  38.99 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  38.41 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  40.37 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  39.44 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  36.13 
 
 		 169 aa  117  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  41.29 
 
 		 212 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  40.13 
 
 		 194 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  40.13 
 
 		 192 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  36.08 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  47.37 
 
 		 194 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  39.33 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  38.46 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  37.16 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  47.66 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  47.66 
 
 		 191 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  33.8 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  32 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  35.92 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  39.58 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  34.94 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  38.19 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  37.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  37.06 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  39.31 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  33.1 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  36.81 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  36.36 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  36.36 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  36.36 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  36.55 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  36 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  39.44 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  35 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  39.44 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.36 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  36.36 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  36.36 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  36.36 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  35.86 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  37.09 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  35.76 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  33.33 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  36.36 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  39.58 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  33.99 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  37.93 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  38.36 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  31.01 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  35.71 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  37.16 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  37.59 
 
 		 194 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  31.97 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  37.91 
 
 		 187 aa  98.2  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  33.56 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  36 
 
 		 205 aa  97.8  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  34.51 
 
 		 165 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  34.53 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  35.48 
 
 		 194 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  35.25 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  35.48 
 
 		 194 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  36.42 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  33.1 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  32.03 
 
 		 187 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  33.77 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0728  CheW protein  34.09 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000233542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  33.77 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  35.86 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>