26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1011 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  74.29 
 
 
447 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  887    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  51.15 
 
 
464 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  49.07 
 
 
466 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  47.17 
 
 
476 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  42.86 
 
 
474 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2558  hypothetical protein  46.11 
 
 
471 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2707  hypothetical protein  43.84 
 
 
460 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.205798  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  36.64 
 
 
510 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  36.03 
 
 
505 aa  264  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  31.52 
 
 
543 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  37.04 
 
 
439 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  32.84 
 
 
542 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  30.5 
 
 
529 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1413  hypothetical protein  31.5 
 
 
510 aa  202  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1883  hypothetical protein  35.47 
 
 
476 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0565061  hitchhiker  0.00344442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  35.59 
 
 
534 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  33.04 
 
 
460 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  28.8 
 
 
454 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  35.44 
 
 
472 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  22.75 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  30.77 
 
 
381 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  30.97 
 
 
447 aa  54.3  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  25.42 
 
 
462 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  24.48 
 
 
464 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  27.14 
 
 
433 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>