119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0943 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 
87 aa  171  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  59.21 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  50.62 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  44.58 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  44.59 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  54.9 
 
 
386 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  50 
 
 
379 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  56.25 
 
 
481 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  47.46 
 
 
172 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  51.92 
 
 
469 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  41.11 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  45.36 
 
 
592 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  41.11 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  43.84 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  41.1 
 
 
188 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  47.46 
 
 
174 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  37.65 
 
 
86 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  37.65 
 
 
86 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  37.65 
 
 
86 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  46.58 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  40.51 
 
 
88 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  40.26 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4128  PAAR  49.15 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  46.67 
 
 
453 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  44.12 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  47.46 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  50.98 
 
 
185 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  37.78 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  39.76 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  37.5 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  47.3 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  43.28 
 
 
88 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  40.21 
 
 
461 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  42.86 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  37.35 
 
 
88 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  41.46 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  41.56 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  40.24 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  40.54 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  42.27 
 
 
456 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  40.24 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  40.24 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  40.24 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  40.24 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  38.46 
 
 
86 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  44.64 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  43.24 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  37.5 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  38.75 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4517  PAAR repeat-containing protein  38.96 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  41.1 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1614  Rhs family protein  39.29 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0130  Rhs family protein  39.29 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904339  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0004  PAAR repeat-containing protein  39.73 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0248137  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  39.29 
 
 
466 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  46.43 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  39.24 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0167  Rhs family protein  39.29 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.688933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0144  PAAR motif-containing protein  39.29 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.352766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  37.8 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  37.8 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  41.67 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  41.33 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  40.96 
 
 
540 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  36.59 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  38.46 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  41.24 
 
 
456 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  34.57 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  35.44 
 
 
107 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  37.5 
 
 
83 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  37.97 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6138  PAAR repeat-containing protein  44.64 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  41.07 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  36.59 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  36.36 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  38.64 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  37.5 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0734  GP29  43.24 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  36.56 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  37.5 
 
 
194 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  43.84 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  43.06 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3641  GP29  43.24 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  43.75 
 
 
177 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2946  PAAR repeat-containing protein  35.48 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  37.35 
 
 
113 aa  42.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  36.67 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  39.29 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  38.27 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6127  PAAR repeat-containing protein  44.64 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0581987  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  41.07 
 
 
85 aa  42  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  41.03 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  32.1 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  42.86 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  39.47 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  36.25 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  37.33 
 
 
1381 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  41.07 
 
 
85 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>