131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0908 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0908  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  1049    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.207571  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1647  filamentation induced by cAMP protein Fic  64.67 
 
 		 502 aa  718    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.887162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1736  filamentation induced by cAMP protein Fic  63.27 
 
 		 502 aa  717    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00739697  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0597  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.59 
 
 		 512 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0910  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.06 
 
 		 564 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1039  filamentation induced by cAMP protein Fic  36 
 
 		 516 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0890  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.32 
 
 		 555 aa  317  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0367824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1534  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.59 
 
 		 537 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6486  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.03 
 
 		 514 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.761112 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2096  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.57 
 
 		 479 aa  300  6e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0353  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.27 
 
 		 495 aa  264  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1561  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.86 
 
 		 536 aa  248  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2478  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.92 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321663  normal  0.723541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0424  hypothetical protein  33.13 
 
 		 512 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00863334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2182  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.24 
 
 		 513 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108003  normal  0.0333314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2191  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.98 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0051  hypothetical protein  30.33 
 
 		 519 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4531  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.23 
 
 		 514 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139108 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6074  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.28 
 
 		 544 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.75 
 
 		 498 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7027  putative filamentation induced by cAMP protein Fic  28.98 
 
 		 537 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.54 
 
 		 511 aa  220  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49750  filamentation induced by cAMP protein  29.3 
 
 		 509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2666  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.94 
 
 		 496 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2025  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.97 
 
 		 507 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.509627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2022  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.49 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.72 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.72 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.72 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.91 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  27.04 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.71 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  28.81 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.82 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.71 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.02 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.05 
 
 		 500 aa  57  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.96 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.3 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  24.43 
 
 		 408 aa  55.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.17 
 
 		 400 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  33.68 
 
 		 394 aa  54.3  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  35.4 
 
 		 376 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  35.4 
 
 		 389 aa  54.3  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.4 
 
 		 376 aa  54.3  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.74 
 
 		 380 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 375 aa  53.9  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.06 
 
 		 251 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.22 
 
 		 502 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.87 
 
 		 381 aa  53.5  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0201  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.67 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496594 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  29.94 
 
 		 377 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.47 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  34.02 
 
 		 328 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.55 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  30.71 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.71 
 
 		 334 aa  51.2  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.84 
 
 		 368 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.69 
 
 		 309 aa  50.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  32 
 
 		 333 aa  50.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  25.97 
 
 		 356 aa  50.4  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.53 
 
 		 387 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  32 
 
 		 333 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.22 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  28.47 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  31.78 
 
 		 368 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  37.04 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  38.81 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  32.17 
 
 		 359 aa  48.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  32.04 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.07 
 
 		 381 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.87 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.04 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.29 
 
 		 371 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0025  putative cAMP-induced filamentation protein  27.62 
 
 		 390 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.337972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.63 
 
 		 374 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.29 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.29 
 
 		 371 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  34.29 
 
 		 371 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.15 
 
 		 384 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0044  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.9 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.203132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4178  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.6 
 
 		 368 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.130851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.29 
 
 		 371 aa  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.69 
 
 		 375 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  26.32 
 
 		 356 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  34.02 
 
 		 348 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  34.02 
 
 		 348 aa  48.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.74 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.91 
 
 		 381 aa  47.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  29.41 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  30.77 
 
 		 330 aa  47.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.11 
 
 		 392 aa  47  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.19 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.54 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.78 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0471  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.93 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.586751  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  33.72 
 
 		 358 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>